lunes, 26 de septiembre de 2011

monos

Un número infinito de monos escribiendo caracteres al azar, genera un infinito número de caracteres al azar. ¿Qué más podrían generar? Aunque falta demostrar que lo que escriben los monos cumple con la definición del azar estadístico.

Si se toman secuencias de esas listas de caracteres que escriben los monos, con longitud Ni (donde i es una obra de Shakespeare) y se compara con esa i obra de Shakespeare. El resultado de esa comparación cuando indica igualdad, permite afirmar que esa lista de caracteres al azar, es una réplica de la i obra de Shakespeare y por lo tanto, que tal mono duplicó al azar la i obra.

Presuponen que con tiempo infinito, tal igualdad eventualmente sucede.

Ese no es el comportamiento de los números al azar; pero intenta sacarle partido a la reducida probabilidad de las combinaciones aleatorias extrañas, que aparentan tener estructura no aleatoria, por ejemplo, equiparable a las de un idioma. Al incrementar la longitud N de una secuencia aleatoria, la probabilidad de contener tal estructura aleatoria extraña, disminuye rápidamente hacia el infinito.

Un infinito número de intentos infinitos, no va a lograr nunca tal secuencia, sobre todo para N tan grandes como en la longitud de las obras de Shakespeare.

El problema es la forzada unión entre una secuencia aleatoria y la enumeración exhaustiva de combinaciones.

La probabilidad asociada a la ocurrencia de un fenómeno, es una esperanza calculada de que suceda, no la obligación de que ocurra tal fenómeno.

Para N de poca longitud, tales como Nj (donde j=9 caracteres) y luego esa secuencia Nj se busca dentro de la secuencia Ni, es otra cosa, porque la probabilidad de correspondencia es más alta y entonces se logran equivalencias. Pero al parecer no para todo contenido de Ni, ya que no citan una efectividad del 100%. [1]

Pero la concatenación de secuencias Nj útiles pero independientes, no es lograr una secuencia Ni. Es tanto como decir que fragmentos de palabras recortadas de periódicos, se unen para generar un collage de significado específico.

Si lo que se quiere es lograr el resultado de 100% concatenando muestras Nj independientes, es más fácil si en vez de Nj se usan Nk, donde k=2. Para rápidamente pasar a otra cosa después de lograr el objetivo.

O aún más fácil, con k=1, donde cada carácter en Ni, desde n=1 hasta Ni, se espera a que el mono lo escriba al azar, para luego de encontrarlo, concatenarlo hasta replicar Ni. Qué mono tan suertudo.

Torito! Esto es una broma. Lo que realmente producen los monos, ademas de darle de golpes, orinar y defecar el teclado[2] es: Notes towards the complete works of Shakespeare // Link

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via:
[1] alt1040: Monos virtuales logran escribir una obra de Shakespeare // Link
[2] wiki: Teorema de los infinitos monos // Link

jueves, 22 de septiembre de 2011

Foldit players

Un paso más en contra del sida. Con Internet y entre todos, si se puede.

La comunidad resuelve la estructura cristalina de la molécula proteasa retroviral del M-PMV (Mason-Pfizer monkey virus, causante de sida en los simios), con el uso del videojuego en línea en 3D, denominado Foldit y confirmado con cristalografía de rayos X. Avances del evento publicados en Khatib et al. (2011).

Esta molécula está relacionada con el proceso de unión del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) con las células sanas.

La proteasa retroviral del M-PMV, cristaliza como un monómero, pero a pesar de que por décadas se tenía la disponibilidad de varias formas cristalinas, los investigadores fueron incapaces de resolver la estructura por remplazamiento molecular (Khatib et al. 2011: 3).

Hipotetizamos que el razonamiento espacial humano, podría mejorar el muestreo del espacio conformacional, así como la determinación de seguir conformaciones subóptimas, cuando los elementos estocásticos de búsqueda, fueron reemplazados con la toma de decisión humana; todo esto en un marco donde los algoritmos deterministas Rosetta, son herramientas del usuario. Desarrollamos un videojuego multijugador en línea, Foldit, con la meta de producir modelos precisos de estructuras de proteínas (Cooper et al. 2010: 2).

El acertijo: fold it: 390: Unsolved monkey virus protein // Link


Cooper, Seth; Firas Khatib; Adrien Treuille; Janos Barbero; Jeehyung Lee; Michael Beenen; Andrew Leaver-Fay; David Baker; Zoran Popovic and Foldit players. 2010. Predicting protein structures with a multiplayer online game. Nature, 446: 756-760 doi:10.1038/nature09304. [a007269fx]

Khatib, Firas; Frank DiMaio; Foldit Contenders Group; Foldit Void Crushers Group; Seth Cooper; Maciej Kazmierczyk; Miroslaw Gilski; Szymon Krzywda; Helena Zabranska; Iva Pichova; James Thompson; Zoran Popovic; Mariusz Jaskolski and David Baker. 2011. Crystal structure of a monomeric retroviral protease solved by protein folding game players. Nature Structural & Molecular Biology, Advance Online Publication, 3 pp doi:10.1038/nsmb.2119. [a007268fx]


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fold it: Solve puzzles for science // Link
fold it: Nature Structural & Molecular Biology paper online! // Link

Protein Data Bank: Crystal structure of monomeric M-PMV retroviral protease // Link
Microbe Wiki: Mason pfizer monkey virus // Link

University of Washington: Zoran Popović // Link

wiki: Foldit // Link
wiki: Rosetta@home // Link

martes, 20 de septiembre de 2011

La Pastora

Opinión del Dr. Arturo Jiménez, sobre la construcción del nuevo estadio de fútbol en el zona adyacente del Parque Zoológico La Pastora (en el Municipio de Guadalupe, Nuevo León, México), en la ultima área de vegetación natural dentro de la ciudad. Parte de la población, está en contra de esta nueva urbanización y desea que se realice en otro lugar.


youtube: 15diario.com: La Pastora. Entrevista con el Biólogo Arturo Jiménez // Link

Se ha discutido hasta el cansancio los motivos por los cuales se solicita se construya el nuevo estadio de fútbol en otro lugar y no en el zona de La Pastora; pero parece que aún no es suficiente. Es pertinente que todos los que habitamos en esta ciudad de Monterrey, entendamos tales motivos.

Actualización (18 de noviembre de 2011). Nueva entrevista:

Guillén, Roberto. 2011. La destrucción de Monterrey: Entrevista con Arturo Jiménez, Biólogo. Axioma México, 3(57): 61-62. // Link

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Sí al estadio, pero en otro lado // Link

sábado, 17 de septiembre de 2011

UARS


real time / alert level / data / statistics

  • NASA: UARS updates // Link
  • Real time satellite tracking: UARS // Link
  • UARS: Project science office page // Link 


Invitación a participar como espectadores en la reentrada a la atmósfera del satélite Upper Atmosphere Research Satellite (UARS) de 6.5 Ton de la NASA. Se espera para el día 23 de septiembre de 2011 (+/- 1 día). No es posible calcular el área de impacto, pero se puede acotar en +/- 57 grados de Latitud.


Actualización final: La reentrada a la tierra fue entre 03:23 a 05:09 GMT del 24 de septiembre de 2011. En tal intervalo de tiempo, su órbita cruzó sobre W África, Madagascar, Océano Índico, Océano Pacífico (con el punto medio de la órbita durante el intervalo), Canadá, Océano Atlántico, NW África, S África y Océano Índico.[1] Aún no hay reporte del lugar preciso de su reentrada.

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[1] NASA: UARS updates: UARS Final Groundtrack // Link

viernes, 16 de septiembre de 2011

monumento

Aunque la historia[1] sobre la quema de la Biblioteca de Alejandría fuera mentira, serviría para crear las letras últimas del mausoleo de la cultura de nuestra especie:

SI·EL·CONTENIDO·DE·LOS·PAPIROS·ESTA·DE·ACUERDO·CON·NUESTRAS·IDEAS·QUEMALOS·NO·LOS·NECESITAMOS·EN·CAMBIO·SI·EL·CONTENIDO·ES·CONTRARIO·ENTONCES·QUEMALOS·NO·HAY·NECESIDAD·DE·CONSERVARLOS

Similar historia fue la de los códices prehispánicos en América, con su destrucción durante la conquista y luego en la colonia. Fueron quemados en la toma de los recintos donde se conservaban (amoxcalli) y en los autos de fe.[2] No todos participaron el la destrucción de la cultura, al contrario, apoyaron su conservación.[3] Pero no fue suficiente.

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[1] tecnología obsoleta: Fanatismo ardiente // Link
[2] iconio: Los códices de México // Link 
[3] Huerta-Lara, Rosario. 2000. Invención, conservación y destrucción del patrimonio cultural de México. Letras Jurídicas, 2: 153-171. // Link

jueves, 8 de septiembre de 2011

Michael S. Hart

Un minuto de silencio a la memoria de Michael S. Hart (1947-2011).

Project Gutenberg: Obituary for Michael Stern Hart // Link

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via:
microsiervos: El Proyecto Gutenberg se queda sin padre // Link

martes, 6 de septiembre de 2011

Oz

"Oz never did give nothin' to the Tin Man, that he didn't, didn't already have". America - Tin Man. [1]

pop / 1974


youtube: America - Tin Man (Holiday) // Link

Es lo que todos necesitamos, saber usar las cosas que tenemos dentro, no hay más.

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[1] wiki: Tin Woodman // Link

lunes, 5 de septiembre de 2011

Global Warming

Global Warming no es una marca de ropaMario Molina, Premio Nobel de Química 1995.[1]

Tu irresponsabilidad, desinterés, ignorancia y otras de tus virtudes te llevarán a sufrir los dulces resultados de un planeta más caliente. ¿De verdad crees nada te va a pasar? El Calentamiento Global se está metiendo a tu casa ahorita mismo. Pero no te preocupes, tu Hummer ocho cilindros está bien chida y tu calle se ve muy limpia y bonita sin esos estorbosos árboles”.[1]

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[1] Editor. 2008. Mario Molina: A nadie le gustan las cocas calientes [entrevista]. Común Once Noventa Universitario, 10(56): 16-17.

wiki: Mario J. Molina // Link

Lo Ultimo Magazine: Diesel y su polémica campaña “Global Warming Ready” // Link
ExpokMASR: Publicidad de Diesel: ¿Y la responsabilidad social? // Link

domingo, 4 de septiembre de 2011

todo lo demás es secundario

Steve Jobs / inspirador / 2005 / Stanford University

"La muerte es el mejor invento de la vida".


youtube: Discurso de Steve Jobs en Stanford // Link

Me recordó una plática que tuve (ca. 2005?) con mi maestro Carlos Treviño, sobre las enfermedades. Le decía: -Deberíamos de tener dos corazones, uno funcionando y el otro de respaldo para cuando falle el primero. El corazón tiene una increíble y rápida capacidad de recuperación, sólo requiere un poco de tiempo para hacerlo. ¿Sabes por qué no tenemos dos corazones? Porque a la evolución no le importa mantenerte con vida a cualquier costo. Si te equivocas, te mueres.

Es la evolución funcionando.

A la evolución no le importa nada, porque no es un organismo al que le pueda importar algo. El rumbo de la evolución está dada por la suma de todos los organismos, vivos o muertos; lo que le pase a un individuo es intrascendente. En la naturaleza cada individuo tarde o temprano se convierte en alimento; abolir esto --la muerte-, no tiene ningún sentido biológico o evolutivo.


Actualización (5 octubre 2011): Es una gran pérdida la partida de alguien que cambió el mundo para mejorarlo. Voto que deberíamos juntarnos para construirle algo en su honor, no se, algo tan permanente como lo son las pirámides, para recordarlo como se merece, por lo que nos queda de eternidad.

sábado, 3 de septiembre de 2011

Cartógrafos

Exploradores.

Con Rodrigo de Bastidas [expedición de 1500] había venido al continente [Americano] uno de esos nombres con instinto de mapa; miran superficies, y mejor aún que el azor que sólo advierte la presa, determinan punto de referencia y contornos, rumbos y alturas; se llamaba Vasco Núñez de Balboa. [...] Después de vencer a los indios se establecieron por allí los españoles y a Vasco Núñez de Baboa lo eligieron alcalde. Aquellos hombres aguerridos no se sometían por el terror al que más ha matado, sino que se daban por sufragio el jefe. Y la elección recaía en el más capaz por la inteligencia, no en el más perverso y cruel, ni en el más astuto, como sucede en las decadencias”. [1]

En la expedición de Alonso de Ojeda en 1499 viajaba Américo Vespucio, quién “en la cámara reducida de una de las naves españolas, trazó el mapa del continente que tomaría su nombre”. [1]

"Por otra parte, no se sabe qué es mas admirable en aquellos hombres: el arrojo del soldado o la pericia del navegante, la elocuencia del conquistador o el patriotismo que los lleva a todos a trabajar por su Castilla, el innato señorío con que hablan y actúan como si fuese el rey quién está bajo su protección y a quién ellos otorgan el beneficio de sus conquistas, sin reservarse para sí otra cosa que la gloria. Pues ni uno de ellos corría a refugiarse en la comodidad así que el oro y las perlas les llenaban las bolsas. Casi sin excepción, siguieron o volvieron a perderse en la luz de los desconocido, mientras que el oro y las perlas se embarcaban para la Corte, a ser derrochados, o caían al fondo del mar en el naufragio, o pasaban al enemigo en el abordaje". [2]

Vasconcelos se pregunta qué es más admirable y entre sus letras tiene sugerida la respuesta: el arrojo del explorador. Partieron al lugar donde pertenecen, a sumergirse en la oscuridad de lo desconocido, de donde algunos no regresaron jamás.

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Del libro que actualmente leo:
Vasconcelos, José. 2002. Breve historia de México. Trillas. 422 pp.

[1] Vasconcelos (2002: 46).
[2] Ibíd, pp 48.