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domingo, 21 de junio de 2015

Todos los del medio terrestre somos extremófilos

Al inicio y por millones de años, la superficie terrestre era esteril...

«Pero hubo que esperar otro centenar de millones de años para que algunos milpiés comenzaran a aventurarse fuera del mar [eran los primeros animales colonizadando la tierra, hace 544–457 millones de años [1]], envueltos en peligrosas concentraciones de oxígeno, lejos del cálido líquido que nos vio nacer, bajo el duro sol. Ahora nos parece tan normal, pero eso es porque la evolución nos ha adaptado a vivir así. Desde este punto de vista, todos los seres que vivimos fuera del agua somos una especie de extremófilos. Venga, en serio: ¿a quién se le ocurre salir del placentero mar que nos vio nacer y donde teníamos de todo para seguir existiendo, mudándonos a un inhóspito pedregal donde no hay apenas agua, con una atmósfera tan oxidante que hasta permite el fuego, expuestos a niveles cancerígenos y genotóxicos de radiación solar...? Bueno, pues lo hicimos». [2]

No sólo eso, ahora andamos explorando el espacio exterior, bajo la misma idea. No podemos medrar allá afuera debido a que no podemos estar sin la gravedad y que la radiación es más extrema y mortal; pero cuando nos adaptemos a la falta de la gravedad, no podermos regresar.

Torito! ¿Qué nos depara el fin de los tiempos? o sea ¿qué andaremos --la vida- haciendo cuando el tiempo del Universo se agote?. ¿Alguna vez olvidaremos el cálido líquido que nos vio nacer? Si, ni idea teníamos del RNA World, hasta que la ciencia nos trajo esa hipótesis al presente.

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[1] Dunn, Casey W. 2013. Evolution: Out of the ocean. Current Biology, 23(6): R241-R243 doi:10.1016/j.cub.2013.01.067. // "These overlapping windows for when animals (544–457 mya) and plants (490–425 mya) arrived on land don’t provide a definitive answer as to who got here first". (pp. R242).

[2] la pizarra de yuri: Viviendo en un planeta joven de un universo bebé // Link

wiki: Extremófilo // Link
wiki: RNA World // Link

sábado, 15 de noviembre de 2014

tendencioso

Los seres humanos tenemos la imperiosa necesidad de que la existencia adquiera sentido y entonces buscamos explicaciones. Pero somos tendenciosos en inclinarnos por la explicación que apoye a las ideas preconcebidas, sin importar su índole. La ciencia es el camino para lograr explicaciones basadas en las evidencias.

Pero las personas no nacen científicas sino mágicas. Si no tenemos cuidado en cómo las explicaciones de la ciencia son interpretadas por las personas, dicha información científica podrán convertirla en religión.
"Dicho de otro modo, existe una necesidad cuasi-religiosa de construir una estructura explicativa, que a menudo infla y distorsiona los hechos. Esta necesidad parece ser especialmente perentoria para todo lo que se refiera al ser humano y su comportamiento" [1]

Torito! ¿La ciencia necesita ser cuidada para que no la conviertan en religión? ¿Se cuida la ciencia? ¿se cuida el método científico? ¿se cuida el hecho científico? o ¿se cuida la educación de las personas que serán científicas? ¿Qué cualidades debe tener un científico?

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[1] La neurociencia como religion // Link

sábado, 13 de septiembre de 2014

earliest metazoan musculature

La --posible- evidencia más antígua de músculos, Haootia quadriformis.1

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1 Liu, Alexander G.; Jack J. Matthews; Latha R. Menon; Duncan McIlroy and Martin D. Brasier. 2014. Haootia quadriformis n. gen., n. sp., interpreted as a muscular cnidarian impression from the Late Ediacaran period (approx. 560 Ma). Procceedings of The Royal Society B: Biological Sciences, 281(1793): 20141202 doi:10.1098/rspb.2014.1202.

sábado, 28 de junio de 2014

prisca


Hace tiempo me preguntaron y respondí que de cierta manera:
-Los científicos somos descendientes de los antiguos magos, ya que la ciencia es hija de la magia: de la naturalis magiae.

La profunda búsqueda del "conocimiento" de las cosas naturales. La principal diferencia es que aquellos magos suponían --y suponen- que cada objeto tiene poderes ocultos susceptibles de ser manipulados a la voluntad de las palabras; los científicos que cada hipótesis debe ser verificada. El resto es historia.

torito! Los antiguos tenían como meta una finalidad inalcanzable, no lo sabían. ¿Para qué se hace ciencia? -Exacto. Pero le falta un detalle al método de la ciencia. Si se incluye ese detalle ¿la madura ciencia actual podría cerrar el círculo? y que nada tiene que ver con la finalidad antigua: la prisca theologia, cosa oculta ni nada parecido.

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vía:
cuaderno de cultura científica: La magia y el nacimiento de la ciencia moderna // Link

Yates, Frances A. 1964. Giordano Bruno and the Hermetic Tradition. Routledge and Kegan Paul, 466 pp.

wiki: Ciencia // Link
wiki: Prisca Theologia // Link

domingo, 1 de junio de 2014

y vale la pena

«3,800 millones de años despues, día a día, sigue siendo un viaje sólo de ida»

torito! Aunque biológicamente en la naturaleza existe la no-vejez y la si-inmortalidad; y ya sabemos cómo curar la vejez y lograr la inmortalidad ¿cómo justificamos que deba aplicarse a nosotros, los humanos?

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sueña, plantea, verifica, ríe, comparte, repite... el método científico emocional.

sábado, 20 de abril de 2013

Apoyo teórico a la panspermia

La evolución de la complejidad genética, modelada y extrapolada[1] según una adaptación de la Ley de Moore, sugiere el origen de la vida hace 9700 millones de años, 5000 millones antes del origen de La Tierra.

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[1] Sharov, Alexei A. and Richard Gordon. 2013. Life before earth. arXiv: 1304.3381 [physics.gen-ph]. // Link

wiki: Panspermia // Link

vía:
neofronteras: ¿Vida antes de la Tierra? // Link

viernes, 15 de febrero de 2013

Proto-RNA

Reportan un polímero de ensamblaje espontáneo en agua, que brinda una estructura química de rudimentaria información genética, como nuevo candidato inicial en el modelo de evolución hacia el RNA, ruta química en el origen de la vida.

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via:
Francis (th)E mule Science's News: Hacia la solución del mayor problema de la hipótesis del mundo de ARN como origen de la vida // Link

Science Now: Self-assembling molecules offer new clues on life's possible origin // Link

Cafferty, Brian J.; Isaac Gállego; Michael C. Chen; Katherine I. Farley; Ramon Eritja and Nicholas V. Hud. 2013. Efficient self-assembly in water of long noncovalent polymers by nucleobase analogues. Journal of the American Chemical Society, doi:10.1021/ja312155v.

The Hud Lab // Link

viernes, 14 de diciembre de 2012

Ancestral Turing-type mechanism

El desarrollo de los dedos sigue un modelo tipo Turing (Sheth et al. 2012).

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Rai, Renuka and Harjinder Singh. 1998. Experiments with a Turing gas. Journal of Biosciences, 23(1): 37-41. // Link

*** Sheth, Rushikesh; Luciano Marcon; M. Félix Bastida; Marisa Junco; Laura Quintana; Randall Dahn; Marie Kmita; James Sharpe and María Angeles Ros-Lasierra. 2012. Hox genes regulate digit patterning by controlling the wavelength of a Turing-type mechanism. Science, 338(6113): 1476-1480 doi:10.1126/science.1226804.

Zhang, Yong-Tao; Mark S. Alber and Stuart A. Newman. 2012. Mathematical modeling of vertebrate limb development. Mathematical Biosciences, in_press doi:10.1016/j.mbs.2012.11.003.

via:
El grupo de la Dra. Ros publica en Science que el patrón de formación de los dedos responde a un modelo tipo Turing // Link

viernes, 17 de agosto de 2012

tic tal' ik

Plantearon que tal organismo debía existir. Determinaron donde buscar su fósil, lo buscaron y lo encontraron.

La descripción de Tiktaalik roseae (gen. et sp. nov.) por Daeschler, Shubin and Jenkins (2006).

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Conway-Morris, Simon. 2010. Evolution: Like any other science it is predictable. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 365(1537): 133-145 doi:10.1098/rstb.2009.0154.

Daeschler, Edward B.; Neil H. Shubin and Farish A. Jenkins. 2006. A Devonian tetrapod-like fish and the evolution of the tetrapod body plan. Nature, 440: 757-763 doi:10.1038/nature04639.

wiki: Tiktaalik // Link

domingo, 1 de julio de 2012

Last ancestor of all life

The last ancestor of all life was a eubacterium with acyl-ester membrane lipids, large genome, murein peptidoglycan walls, and fully developed eubacterial molecular biology and cell division. It was a non-flagellate negibacterium with two membranes, probably a photosynthetic green non-sulphur bacterium with relatively primitive secretory machinery, not a heterotrophic posibacterium with one membrane. [1]

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[1] Cavalier-Smith, Thomas. 2006. Rooting the tree of life by transition analyses. Biology Direct, 1:19 doi:10.1186/1745-6150-1-19.

viernes, 15 de junio de 2012

Por qué hay tantos ladrones

Del cómo la avaricia irracional de unos pocos que ostentan el poder, es suficiente para dar al traste con el orden social y convertir lo que debería ser felicidad en el infierno de muchos.

Desde 1516, Thomas More lo dejó bien comprendido en su escrito “La mejor república y la isla de Utopía[1]. De entre las causas con las que explica para su época ¿por qué hay tantos ladrones?, More considera: las ovejas. Es interesante conocer su argumento: una cadena de eventos que inicia con el acaparamiento de un recurso, la tierra, y notar que aplica a nuestro presente.

Ninguna situación aquí marcada es una sorpresa, pero resalta el cinismo de que aún sigan sucediendo:

-Pero todo esto no es únicamente el motivo por el cual existen tantos ladrones. Hay también otro, y más importante, según creo, particularmente en vuestro país.

-¿Cuál es? -quiso saber el cardenal.

-Las ovejas -le conteste-. Vuestras ovejas, que tan dulces suelen ser y que tan poco exigen para su alimentación, ahora, según oí decir, se muestran tan feroces y tragonas que hasta engullen a los hombres, y destruyen, despueblan y devoran campos, casas y ciudades. Verdaderamente, en todos los lugares del país donde se obtiene la mejor calidad de lana, los señores, los caballeros y hasta los santos varones de los abades no se conforman con las rentas y beneficios que sus antepasados solían obtener de sus posesiones, y no estando satisfechos de poder vivir ociosamente, sin ser de ningún modo útiles a la sociedad, antes bien perjudiciales, no dejan ninguna parcela dedicada al cultivo, sino que por el contrario se reserva toda para los pastos, destruyendo casas y pueblos, y si las iglesias son respetadas, seguramente es porque les valen para los establos. Y como si no se perdiese bastante tierra en dehesas y cotos, esos dignos varones convierten aquellas anteriormente fértiles tierras en desiertos. De modo que, para un devorador insaciable, desgracia y ruina de su patria, pueda poseer gran abundancia de pastos, muchos labriegos se ven desposeídos de sus bienes, los unos estafados, otros expulsados violentamente, o bien, colmada ya su paciencia después de sufrir tantas humillaciones, se han visto obligados a vender lo que tenían. De todas formas, esos desventurados hombres y mujeres, maridos y esposas, huérfanos y viudas, emigran llevando los padres a sus pequeños, y estas familias son más numerosas que ricas, ya que la tierra necesita muchos brazos, y se ven todos obligados a marchar. Dejan sus casas y sus amigos y no saben donde refugiarse. Sus ajuares, por los que no podrían obtener mucho, suponiendo que encuentren quien se los compre, se ven obligados a venderlos por un precio vil que no les vale para sostenerse mucho tiempo. Entonces no les queda otro recurso que hurtar [que en ciertos casos tiene pena de muerte], por donde llegarán a la cárcel, o se resignan a pedir limosnas. Pero también en este caso los detienen por mendigos que no trabajan, ya que nadie quiere sus servicios, aunque ellos se ofrezcan con la mayor voluntad, porque su oficio es trabajar la tierra, pero donde no se ha sembrado nada, tampoco hay necesidad de brazos, y un zagal y un rabadán se bastan para guardar las ovejas en una tierra que reclamaba muchos brazos cuando se cultivaba. Y por este mismo motivo la comida es muy cara en muchos sitios. Como ha subido el precio de la lana, los pequeños artesanos no pueden comprarla, viéndose obligados a dejar su oficio. Después de aquel aumento de rebaños, la glosopeda se ha cebado en las ovejas, como si Dios, ante la avaricia de los propietarios, les hubiera enviado esta plaga, aunque habría sido más justo que los hubiera castigado a ellos y no al ganado.

Aunque el número de las ovejas se incremente muchísimo, su coste no bajará, ya que la venta de las lanas, aunque no esté monopolizada, o sea en poder de uno solo, está por lo menos “oligopolizada”. Realmente, está en poder de muy pocas personas ricas, que no tienen ninguna necesidad de vender antes del momento que ellos eligen, y que naturalmente es cuando les interesa el precio. Por la misma causa todas las demás clases de ganado han subido de precio, incluso más, porque, destruidas las granjas y la agricultura, nadie se dedica ya a su cría. Y a los ricos interesan más sus ovejas que la reproducción del ganado bovino, el cual compran lejos por un precio muy elevado. Pero opino que todavía no se han sufrido los inconvenientes de este sistema. Hasta ahora, la escasez solamente se ha notado en los lugares donde re realizan las ventas. Aunque cuando hayan sacado de todas partes más ganado del que puede nacer, se llegará a una reducción en el número de animales, y el país padecerá una extremada escasez. De modo que, por la avaricia irracional de unos cuantos, lo que parecía una gran prosperidad de vuestra isla degenerará en su ruina.

El aumento del coste de la vida trae consigo el que la mayoría de los hacendados despidan a gran parte de sus servidores, y éstos, ¿qué otra solución tienen si no pedir limosna o bien robar, cosa que admiten buenamente muchos nobles? Y esa lamentable escasez y a esa necesidad, agréguense el lujo innecesario, pues los criados que sirven a los nobles, los artesanos y hasta los mismos campesinos, todas las clases sociales, tienden al despilfarro, tanto en el vestir como en el comer. Además, los bodegones, los burdeles y los innobles juegos de azar, las cartas, los dados, la pelota y los bolos ¿no vacían con gran rapidez la bolsa de sus aficionados y les impulsa al robo? [...]

Si no corregís esos daños, alabaréis inútilmente esa justicia tan experta en reprimir el robo, pues es más aparente que benéfica y justa. Permitís que se eduque tan deficientemente a los niños y que sus costumbres se corrompan desde pequeños; pero después los condenáis, al llegar a hombres, por faltas que en su niñez ya eran previsibles. ¿Qué otra cosa es esto más que hacerles ladrones y condenarlos después? (Pp. 46-50).


Torito! ¿Por qué unos pocos pueden acaparar impunemente los recursos? ¿Por qué las leyes los protegen? ¿La ley sujeta a interpretaciones tiene algo que ver?

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Del libro que actualmente leo:
[1] Moro, Tomás. 1984. Utopía. SARPE, 178 p.

domingo, 10 de junio de 2012

Bacteria: -Outdated human id

Microbiológica fuerza selectiva en el origen de los humanos modernos: la inactivación de los genes SIGLEC.

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Wang, Xiaoxia; Nivedita Mitra; Ismael Secundino; Kalyan Banda; Pedro Cruz; Vered Padler-Karavani; Andrea Verhagen; Chris Reid; Martina Lari; Ermanno Rizzi; Carlotta Balsamo; Giorgio Corti; Gianluca De_Bellis; Laura Longo; NISC Comparative Sequencing Program; William Beggs; David Caramelli; Sarah A. Tishkoff; Toshiyuki Hayakawa; Eric D. Green; James C. Mullikin; Victor Nizet; Jack Bui and Ajit Varki. 2012. Specific inactivation of two immunomodulatory SIGLEC genes during human evolution. Proceedings of the National Academy of Sciences, doi:10.1073/pnas.1119459109.

via:
Pileta de Prehistoria: How infectious disease may have shaped human origins // Link

University of California: Varki Lab // Link
University of California: Nizet Lab // Link

sábado, 9 de junio de 2012

Moral

"La moral fuerza la naturaleza del ser humano. Entonces se debe aprender y se debe aprender bien, porque entre todos vivimos las consecuencias"

Torito! Considerando la situación actual del mundo, en donde a escala global los principales problemas son la población y el ambiente ¿cual moral es la correcta?

Buscar la solución de los problemas ecológicos apelando al libre albedrío de la conciencia --por concientización-, cuando las herramientas de la moral son deficientes, es como querer saciar el hambre, con la buena voluntad de un grano de arroz.

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wiki: Moral // Link.

sábado, 19 de mayo de 2012

Último ancestro común bilaterio

[Nuestros] resultados implican que el último ancestro común bilaterio era pequeño, bentónico, de desarrollo directo, sin segmentos, cavidades celómicas, nefridios o verdadero cerebro. Esto sugiere un largo periodo pre-Cámbrico, en el que de diferentes linajes de bilaterios simples, surgieron otros más complejos que se diversificaron durante la explosión del Cámbrico (Baguña et al. 2001: s133).

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Baguña, Jaume and Marta Riutort. 2004. The dawn of bilaterian animals: The case of acoelomorph flatworms. BioEssays, 26(10): 1046-1057 doi:10.1002/bies.20113.

*** Baguña, Jaume; Iñaki Ruiz-Trillo; Jordi Paps; Merce Loukota; Carles Ribera; Ulf Jondelius and Marta Riutort. 2001. The first bilaterian organisms: Simple or complex? New molecular evidence. International Journal of Developmental Biology, 45(S1): S133-S134.

Chen, Jun-Yuan; David J. Bottjer; Paola Oliveri; Stephen Q. Dornbos; Feng Gao; Seth Ruffins; Huimei Chi; Chia-Wei Li and Eric H. Davidson. 2004. Small bilaterian fossils from 40 to 55 million years before the Cambrian. Science, 305(5681): 218-222 doi:10.1126/science.1099213.

Erwin, Douglas H. and Eric H. Davidson. 2002. The last common bilaterian ancestor. Development, 129: 3021-3032.

Finnerty, John R. 2003. The origins of axial patterning in the metazoa: How old is bilateral symmetry?. International Journal of Developmental Biology, 47: 523-529.

Freeman, Gary. 2009. The rise of bilaterians. Historical Biology, 21(1-2): 99-114 doi:10.1080/08912960903295843.

Malakhov, V. V. 2004. New ideas on the origin of bilateral animals. Russian Journal of Marine Biology, 30(suppl. 1): s22-s33 doi:10.1007/s11179-005-0019-4.

Rieger, Reinhard and Peter Ladurner. 2001. Searching for the stem species of the Bilateria. Belgian Journal of Zoology, 131(suppl. 1): 27-34.

Xiao, Shuhai; Michal Kowalewski; Bing Shen; Lin Dong and Marc Laflamme. 2009. The rise of bilaterians: A reply. Historical Biology, 21(3-4): 239-246 doi:10.1080/08912960903471659.

viernes, 13 de abril de 2012

Otavia antiqua

Brain et al. (2012) reportan el fósil animal más antiguo, un espongiforme de Namibia denominado Otavia antiqua, que antecede en 150-100 Ma a cualquier otro fósil de animal propuesto y ademas previo a los cambios climáticos extremos y el aumento gradual de oxígeno en el Ediacárico.

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Brain, Charles Kimberlin; Anthony R. Prave; Karl-Heinz Hoffmann; Anthony E. Fallick; Andre Botha; Donald A. Herd; Craig Sturrock; Iain Young; Daniel J. Condon and Stuart G. Allison. 2012. The first animals: Ca. 760-million-year-old sponge-like fossils from Namibia. South African Journal of Science, 108(1-2) 658 doi:10.4102/sajs.v108i1/2.658.

Gess, Robert W. 2012. The oldest animal fossils. South African Journal of Science, 108(1-2) 1064 doi:10.4102/sajs.v108i1/2.1064.

Love, Gordon D.; Emmanuelle Grosjean; Charlotte Stalvies; David A. Fike; John P. Grotzinger; Alexander S. Bradley; Amy E. Kelly; Maya Bhatia; William Meredith; Colin E. Snape; Samuel A. Bowring; Daniel J. Condon and Roger E. Summons. 2009. Fossil steroids record the appearance of Demospongiae during the Cryogenian period. Nature, 457: 718-722 doi:10.1038/nature07673.

viernes, 30 de marzo de 2012

Systems of creation

Al nivel más fundamental, la vida como la conocemos es un fenómeno material [físico-químico], que genera y mantiene su existencia como sistema autocontenido por procesos internos autoregulados y acoplados al ambiente externo (Mann 2012: a).

El concepto de evolución molecular, es la madre química de la evolución biológica (citado por Mann 2012: b).

Las células son máquinas [fisico-] químicas, codificadas en lenguaje químico (Mann 2012: b).

Enmarcado en lo anterior, Mann (2012), indica que respecto al origen de la vida, es significativa la aparición de la celularidad, esa teórica línea entre los sistemas protovivos --con primitivas funciones similares a las observadas en la vida- y los vivos, estimada en 500 millones de años.

torito! ¿Cuál es la definición de la vida como fenómeno inmediatamente posterior a su origen? y ¿cómo se compara tal definición con nuestro conocimiento de fenómeno vida observado de la actualidad?

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Anderson, P. W. 1983. Suggested model for prebiotic evolution: The use of chaos. PNAS, 80(11): 3386-3390.

Anet, Frank A. L. 2004. The place of metabolism in the origin of life. Current Opinion in Chemical Biology, 8: 654-659 doi:10.1016/j.cbpa.2004.10.005.

Deamer, David W.; Jason P. Dworkin; Scott A. Sandford; Max P. Bernstein and Louis J. Allamandola. 2002. The first cell membranes. Astrobiology, 2: 371-381.

Dickerson, Richard E. 1971. The phenomenon of life: What is unique to life wherever it may be found, and what features of life are accidents of its history on this particular planet?. Engineering and Science Monthly, 34(4): 4-11.

Dix, Douglas E. 2002. What is life? Prerequisites for a definition. Yale Journal of Biology and Medicine, 75(5-6): 313-321.

Gómez-Caballero, J. Arturo y Jerjes Pantoja-Alor. 2003. El origen de la vida desde un punto de vista geológico. Boletín de la Sociedad Geológica Mexicana, 56(1): 56-86.

Kasting, James F.; Kevin J. Zahnle; J. P. Pinto and A. T. Young. 1989. Sulfur, ultraviolet radiation, and the early evolution of life. Origins of Life and Evolution of the Biosphere, 19: 95-108.

Keosian, John. 1960. On the origin of life. Science, 131(3399): 479-482 doi:10.1126/science.131.3399.479.

Lazcano-Araujo, Antonio. 1983. Los sistemas precelulares. Pp. 51-59 in: El origen de la vida: Evolución química y evolución biológica. Trillas, México. 107 pp.

*** Mann, Stephen. 2012. Systems of creation: The emergence of life from nonliving matter. Accounts of Chemical Research, doi:10.1021/ar200281t.

Martin, William and Michael J. Russell. 2002. On the origins of cells: A hypothesis for the evolutionary transitions from abiotic geochemistry to chemoautotrophic prokaryotes, and from prokaryotes to nucleated cells. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 358(1429): 59-85 doi:10.1098/rstb.2002.1183.

ND. 1906. The origin of life. British Medical Journal, 1(2359): 629-630.

ND. 1927. The origin of life. American Journal of Public Health (NY), 17(8): 830-832.

Nolan, Kevin. 2008. The origin of life on Earth. Pp. 21-41 in: Mars, A cosmic stepping stone. Praxis Publishing Ltd, 384 Pp. doi:10.1007/978-0-387-49981-9_2.

Oró, J.; Stanley L. Miller and Antonio Lazcano-Araujo. 1990. The origin and early evolution of life on Earth. Annual Review of Earth and Planetary Sciences, 18: 317-356.

Oschmann, Wolfgang; Manfred Grasshof and Michael Gudo. 2002. The early evolution of the planet earth and the origin of life. Palaeobiodiversity and Palaeoenvironments, 82(1): 284-294 doi:10.1007/BF03043789.

Penny, David. 2005. An interpretive review of the origin of life research. Biology and Philosophy, 20(4): 633-671 doi:10.1007/s10539-004-7342-6.

Popa, Radu. 2004. Between necessity and probability: Searching for the definition and origin of life. Springer, 252 pp.

Raup, David M. and James W. Valentine. 1983. Multiple origins of life. PNAS, 80: 2981-2984.

Schrum, Jason P.; Ting F. Zhu and Jack W. Szostak. 2010. The origins of cellular life. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, Published in Advance May 19, 2010, doi:10.1101/cshperspect.a002212.

Urey, Harold C. 1952. On the early chemical history of the earth and the origin of life. PNAS, 38: 351-363.

Wachtershauser, Gunter. 1990. Evolution of the first metabolic cycles. PNAS, 87(1): 200-204.

Wachtershauser, Gunter. 2000. Origin of life: Life as we don't know it. Science, 289(5483): 1307-1308 doi:10.1126/science.289.5483.1307.


via:
yahoo! Groups: Abiogenesis_Chemical_Evolution: Origin of life, spontaneous generation, Abiogenesis_Chemical_Evolution // Link

domingo, 26 de febrero de 2012

sólo hay una oportunidad

En la caricatura de la secuencia evolutiva del ser humano[1], en donde ordenan diferentes especies como si fueran nuestros ancestros. El más reciente de la fila --algún listo de entre nosotros-, escudriña el entorno, se detiene, se gira y le dice a los demás que lo siguen en serie:
-Eh raza, algo salió mal, ¡regrésense!

La vida no es videojuego de puntajes y vidas extras. Es aquí y ahora. El que se equivoca... no hay "mejor suerte para la próxima". La vida perdida no retorna. Cada evento es único e irrepetible, en tiempo, ubicación, materia y energía; además genera ineludibles consecuencias.

Torito! ¿Donde está el manual del uso de la vida? para conocer a que nos enfrentamos; y no estar suponiendo.


big beat / 1999


youtube: Fatboy Slim - Right here, right now // Link

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[1] vista en Internet.

lunes, 30 de enero de 2012

Biólogo II

Aprovechando [5 de febrero de 2012] la nueva funcionalidad de facebook, llamada "Timeline", retro-traigo unos buenos tweets de broma/vivencia, del 30 de enero de 2012:

Yo: -Oh yeah !!!
[y a continuación comparto una imagen vista en Internet, que lleva por título "Cuando digo que soy Biólogo...". Esta se compone de 3 secciones:
  1. Los otros me ven así. Con dos fotografías, una de Indiana Jones blandiendo con furia su látigo y otra de Steve Irwin, sonriendo y con un koala en su hombro izquierdo.
  2. Mis padres me ven así. Con una foto y un dibujo. La foto es de un hippie[1] de pelo y barba larga, pañoleta de colores a la frente, lengua de fuera y el símbolo de Amor y Paz de su mano izquierda. El dibujo es "de un compatriota que ha caído en desgracia"[2], de ropa roída y barba de ayer, sentado con un letrero a su cuello y que agita un vaso pidiendo monedas, entre algunas moscas que lo rodean.
  3. Y yo me veo así. Formado de tres fotos, con la central de mayor tamaño y que muestra a una flamante estrella de rock[3] vestida de cuero, levantando los brazos para formar el símbolo de la victoria y con sus manos "rock" y "el número uno", en un escenario a punto de la histeria. La foto de la izquierda es bajo el agua, donde un buzo[4] toma notas de campo y una cría de manatí reposa su rostro sobre el escrito. La tercer foto es de un importante científico americano[5], Biólogo, de mirada seria inexpresiva, de pelo y barba blanca, camisa azul, junto a un microscopio profesional con cámara digital.]

AV: -Me gusta.

Yo: -Creo que lo que prevalece, es como me ven mis padres... jajaja.

DO: -Mi shamu mayor quiere ser Bióloga, pero no se si lo que espera de la Biología sea cierto, jajaja. Estas imágenes me confirman que ella debería informarse mejor :) Ojala sea lo que ella espera.

Yo. -Biólogo parece muchas cosas, pero realmente es solo una: solucionar problemas biológicos con el uso del método científico. Los problemas biológicos son tema de la Biología y, la Biología es todo lo relacionado con la vida. Cada recoveco de esta disciplina, tiene su propio nivel de integración (u organización) y lugar (o hábitat). Es tan grande que entonces el Biólogo se especializa, ya sea en ratones, virus, ecosistemas o alguna de miles y miles de millones de otras opciones. Obtener ingresos de esto, cuesta sangre, y depende de la formación, pericia, astucia y esfuerzo de cada quién; pasando por algo de suerte y amigos que den la mano de vez en cuando. El título de Biólogo, es solo una patente [que junto a la cédula profesional, autorizan ejercer la profesión]. El auténtico Biólogo es el que entiende y ama la biología, y por [entender y] amar la Biología, sabe que es lo correcto hacer para cada problema biológico (independientemente de si conoce o no, técnicas o métodos). No todos los que se dicen Biólogos, son Biólogos, también hay piratas en esta profesión.

DO: -Mmm, pues creo que ella no tiene idea de esto, quiere ser Bióloga porque le gustan los animales y las plantas (según dice ella) pero no lo se, insisto que tiene una idea equivocada de la Biología. Lo bueno, le faltan al menos 4 años antes de realmente tomar una decisión, en los cuales puede informarse de qué es lo que realmente desea :)

Yo: -Que le gusten las plantas y animales, es un gran paso hacia la Biología, pero no es la única carrera asociada a esto. Hay otras, por ejemplo la Veterinaria, la Agronomía, etc. El Biólogo soluciona problemas biológicos (de microbios, plantas o animales) con el uso del método científico. Ejemplo de problema biológico: los jaguares se están acabando ¿es esto cierto? [Todas las respuestas deben tener evidencia comprobable de campo]. Y si es cierto ¿que se debe hacer para revertirlo? ¿Se deben dejar que se acaben? ¿se deben crear o cambiar leyes? ¿se debe restaurar o mejorar su hábitat? ¿se debe prohibir su cacería o fomentar su reproducción en cautiverio? ¿hay alguna enfermedad que los está diezmando y requieren tratamiento? ¿no tienen suficiente variación genética? ¿su alimento, sus presas, se están acabando? etc.

DO: -Le haré llegar tu enfoque :)

Yo: -Por si les interesa saber quienes aparecen en las fotos: A) El actor Harrison Ford como Indiana Jones. B) El ecologista australiano Stephen Robert Irwin (Steve Irwin). C) El cantante de rock es el actor Jason Flemyng (interpretando a Bobby Beers/Grupo Steel Dragon) del film Rock Star (Stephen Herek, 2001). D) El buzo es la Bióloga Marina Barbara Bernier en el Homosassa Springs Wildlife State Park, Florida. E) El científico junto al microscopio es el Biólogo Craig Venter, presidente fundador de Celera Genomics y que realizó su propio Proyecto Genoma Humano.

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[1] Desconocido.
[2] Frase modificada de alguna caricatura de Bugs Bunny.
[3] Jason Flemyng (Bobby Beers/Grupo Steel Dragon). Del film Rock Star (Stephen Herek, 2001).
[4] Bióloga Marina Barbara Bernier // Link.
[5] Biólogo Craig Venter // Link.

[publicado originalmente el 30 de enero de 2012 en mi facebook]

sábado, 28 de enero de 2012

Oportunidad ambiental

Considerando desde los fósiles más antiguos, el máximo tamaño corporal se ha incrementado en 16 órdenes de magnitud. Dentro de este incremento, se observan dos saltos discretos de similar magnitud, con innovación en la complejidad corporal y de posible relación con el incremento del oxígeno atmosférico (Payne et al. 2009: 24):

Salto Fecha Era Innovación
1 ca. 1.9 Ga Mediados del Paleoproterozoico Célula eucariota
2 0.6-0.45 Ga Final del Neoproterozoico e inicio del Paleozoico Multicelularidad


Holland (2006) describe las cinco etapas de oxigenación en la historia de La Tierra:

Etapa Fecha Característica
1 3.85-2.45 Ga El ambiente casi o totalmente anóxico.
2 2.45-1.85 Ga El nivel de oxígeno estimado en 0.02 y 0.04 atm. Océanos profundos anóxicos.
3 1.85-0.85 Ga Oxigenación leve de océanos profundos.
4 0.85-0.54 Ga El nivel de oxígeno estimado en 0.2 atm. Océanos profundos anóxicos (por lo menos en las glaciaciones).
5 0.54 Ga-presente Nivel de oxígenación actual. Oxigenación fluctuante de océanos profundos.


Torito! Se supone que en las primeras etapas de la evolución de la vida en La Tierra, el oxígeno era un subproducto biológico tóxico que empezó a acumularse en la atmósfera. Fue tan grande su efecto, que la vida tuvo que adaptarse y cambiar. Lo que inició como una tragedia mortal para la vida antigua, se convirtió en una oportunidad ambiental para la nueva. Solo se requiere de un puñado de millones de años y la evolución hace el resto. ¿Esto se aplica a nuestra contaminación? ¿Qué tan permanente es nuestra contaminación?

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Berner, Robert A. 1999. Atmospheric oxygen over Phanerozoic time. PNAS, 96: 10955-10957.

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lunes, 19 de diciembre de 2011

¿La Explosión Cámbrica es un artefacto?

Artefacto en el sentido de falta de fósiles previos de los phyla de la Explosión Cámbrica. Según la reseña de Pisani (2011), sobre la investigación publicada en Erwin et al. (2011), la respuesta es: no.

Torito! ¿Donde entra Vendobionta en el exaustivo arbol filogenético tipo cronograma que presentan?
  1. Demospongiae
  2. Calcarea Homoscleromorpha
  3. Placozoa
  4. Cnidaria
  5. Hemichordata Echinodermata Cephalocordata Urochordata Vertebrata
  6. Priapulida Nematoda Onychophora Arthropoda
  7. Rotifera Ectoprocta
  8. Platyelminthes Nemertea
  9. Phoronida Brachiopda Mollusca
  10. Annelida
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Erwin, Douglas H.; Marc Laflamme; Sarah M. Tweedt; Erik A. Sperling; Davide Pisani and Kevin J. Peterson. 2011. The Cambrian conundrum: Early divergence and later ecological success in the early history of animals. Science, 334(6059): 1091-1097 doi:10.1126/science.1206375. [a007455fx]

Pisani, Davide. 2011. The Cambrian conundrum: A new perspective. Bioinformatics and Molecular Evolution Unit, accesado 18 diciembre 2011. [a007460fx] // Link

wiki: Artefacto (error de observación) // Link