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sábado, 13 de septiembre de 2014

earliest metazoan musculature

La --posible- evidencia más antígua de músculos, Haootia quadriformis.1

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1 Liu, Alexander G.; Jack J. Matthews; Latha R. Menon; Duncan McIlroy and Martin D. Brasier. 2014. Haootia quadriformis n. gen., n. sp., interpreted as a muscular cnidarian impression from the Late Ediacaran period (approx. 560 Ma). Procceedings of The Royal Society B: Biological Sciences, 281(1793): 20141202 doi:10.1098/rspb.2014.1202.

miércoles, 22 de mayo de 2013

successful regeneration

Documentamos el requisito absoluto de los macrófagos, en la orquestación del microambiente inmune pos-amputación y la formación de la blastema (masa de células des-diferenciadas), proporcionando evidencia directa del control inmunológico en la regeneración exitosa en un vertebrado adulto (Godwin et al. 2013: 1).

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Godwin, James W.; Alexander R. Pinto and Nadia A. Rosenthal. 2013. Macrophages are required for adult salamander limb regeneration. Proceedings of the National Academy of Sciences, early edition, doi:10.1073/pnas.1300290110.

vía:
alt1040: Así regeneran su cuerpo las salamandras // Link

viernes, 14 de diciembre de 2012

Ancestral Turing-type mechanism

El desarrollo de los dedos sigue un modelo tipo Turing (Sheth et al. 2012).

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Rai, Renuka and Harjinder Singh. 1998. Experiments with a Turing gas. Journal of Biosciences, 23(1): 37-41. // Link

*** Sheth, Rushikesh; Luciano Marcon; M. Félix Bastida; Marisa Junco; Laura Quintana; Randall Dahn; Marie Kmita; James Sharpe and María Angeles Ros-Lasierra. 2012. Hox genes regulate digit patterning by controlling the wavelength of a Turing-type mechanism. Science, 338(6113): 1476-1480 doi:10.1126/science.1226804.

Zhang, Yong-Tao; Mark S. Alber and Stuart A. Newman. 2012. Mathematical modeling of vertebrate limb development. Mathematical Biosciences, in_press doi:10.1016/j.mbs.2012.11.003.

via:
El grupo de la Dra. Ros publica en Science que el patrón de formación de los dedos responde a un modelo tipo Turing // Link

viernes, 7 de diciembre de 2012

Neural crest

'The only interesting thing about vertebrates was the neural crest' Peter Thorogood comment (Donoghue et al. 2008: 530).
torito! Y no es para menos. ¿Cómo anacuas (de Ehretia anacua) evolucionó el sistema cresta neural, en el que un conjunto de células del pliegue neural --una estructura temporal en la neurulación-, viajarán y se diferenciarán en diferentes partes del cuerpo, originando hueso (osteocitos), cartílago (condrocitos), dentina (odontoblastos), neuronas, glia y células pigmentadas (iridióforos, xantóforos, eritróforos y melanocitos)?

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Abitua, Philip Barron; Eileen Wagner; Ignacio A. Navarrete and Michael Levine. 2012. Identification of a rudimentary neural crest in a non-vertebrate chordate. Nature, 492: 104-107 doi:10.1038/nature11589.

Baker, Clare V. H. 2008. The evolution and elaboration of vertebrate neural crest cells. Current Opinion in Genetics and Development, 18(6): 536-543 doi:10.1016/j.gde.2008.11.006.

Bronner, Marianne E. and Nicole M. LeDouarin. 2012. Development and evolution of the neural crest: An overview. Developmental Biology, 366(1): 2-9 doi:10.1016/j.ydbio.2011.12.042.

*** Donoghue, Philip Conrad James; Anthony Graham and Robert N. Kelsh. 2008. The origin and evolution of the neural crest. BioEssays, 30(6): 530-541 doi:10.1002/bies.20767.

Gans, Carl and R. Glenn Northcutt. 1983. Neural crest and the origin of the vertebrates: A new head. Science, 220(4594): 268-273 doi:10.1126/science.220.4594.268.

Hall, Brian K. and J. Andrew Gillis. 2012. Incremental evolution of the neural crest, neural crest cells and neural crest-derived skeletal tissues. Journal of Anatomy, 221(6): early view doi:10.1111/j.1469-7580.2012.01495.x.

Holland, Linda Z. and Nicholas D. Holland. 2001. Evolution of neural crest and placodes: Amphioxus as a model for the ancestral vertebrate?. Journal of Anatomy, 199(1-2): 85-98 doi:10.1046/j.1469-7580.199.parts1-2.8.x.

Jeffery, William R.; Takuto Chiba; Florian Razy Krajka; Carole Deyts; Nori Satoh and Jean-Stéphane Joly. 2008. Trunk lateral cells are neural crest-like cells in the ascidian Ciona intestinalis: Insights into the ancestry and evolution of the neural crest. Developmental Biology, 324: 152-160.

Sauka-Spengler, Tatjana and Marianne Bronner-Fraser. 2006. Development and evolution of the migratory neural crest: A gene regulatory perspective. Current Opinion in Genetics and Development, 16(4): 360-366 doi:10.1016/j.gde.2006.06.006.

Schlosser, Gerhard. 2008. Do vertebrate neural crest and cranial placodes have a common evolutionary origin?. BioEssays, 30(7): 659-672 doi:10.1002/bies.20775.

Trainor, Paul A.; Kristin R. Melton and Miguel Manzanares. 2003. Origins and plasticity of neural crest cells and their roles in jaw and craniofacial evolution. International Journal of Developmental Biology, 47: 541-553.

Wada, Hiroshi and Kaz Makabe. 2006. Genome duplications of early vertebrates as a possible chronicle of the evolutionary history of the neural crest. International Journal of Biological Sciences, 2(3): 133-141 doi:10.7150/ijbs.2.133.

Yu, Jr-Kai Sky. 2010. The evolutionary origin of the vertebrate neural crest and its developmental gene regulatory network: Insights from amphioxus. Zoology, 113(1): 1-9 doi:10.1016/j.zool.2009.06.001.

miércoles, 27 de junio de 2012

No evidence of sexual selection

Según Gowaty et al. (2012), el experimento original de Bateman (1948) sobre selección sexual, estaba sesgado en el método para identificar individuos de Drosophila melanogaster emparentados.

Bateman (1948: 353) mencionaba que su experimento utilizaba una novedosa manera de relacionar selección y fertilidad.

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Bateman, Angus John. 1948. Intra-sexual selection in Drosophila. Heredity, 2: 349-368 doi:10.1038/hdy.1948.21.

Gowaty, Patricia Adair; Yong-Kyu Kim and Wyatt W. Anderson. 2012. No evidence of sexual selection in a repetition of Bateman's classic study of Drosophila melanogaster. Proceedings of the National Academy of Sciences, doi:10.1073/pnas.1207851109.

vía:
sciencedaily: Biologists reveal potential 'fatal flaw' in iconic sexual selection study // Link
UCLA Newsroom: UCLA biologists reveal potential 'fatal flaw' in iconic sexual selection study // Link

UCLA: Department of Ecology and Evolutionary Biology: Patricia Adair Gowaty // Link

sábado, 19 de mayo de 2012

Último ancestro común bilaterio

[Nuestros] resultados implican que el último ancestro común bilaterio era pequeño, bentónico, de desarrollo directo, sin segmentos, cavidades celómicas, nefridios o verdadero cerebro. Esto sugiere un largo periodo pre-Cámbrico, en el que de diferentes linajes de bilaterios simples, surgieron otros más complejos que se diversificaron durante la explosión del Cámbrico (Baguña et al. 2001: s133).

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Baguña, Jaume and Marta Riutort. 2004. The dawn of bilaterian animals: The case of acoelomorph flatworms. BioEssays, 26(10): 1046-1057 doi:10.1002/bies.20113.

*** Baguña, Jaume; Iñaki Ruiz-Trillo; Jordi Paps; Merce Loukota; Carles Ribera; Ulf Jondelius and Marta Riutort. 2001. The first bilaterian organisms: Simple or complex? New molecular evidence. International Journal of Developmental Biology, 45(S1): S133-S134.

Chen, Jun-Yuan; David J. Bottjer; Paola Oliveri; Stephen Q. Dornbos; Feng Gao; Seth Ruffins; Huimei Chi; Chia-Wei Li and Eric H. Davidson. 2004. Small bilaterian fossils from 40 to 55 million years before the Cambrian. Science, 305(5681): 218-222 doi:10.1126/science.1099213.

Erwin, Douglas H. and Eric H. Davidson. 2002. The last common bilaterian ancestor. Development, 129: 3021-3032.

Finnerty, John R. 2003. The origins of axial patterning in the metazoa: How old is bilateral symmetry?. International Journal of Developmental Biology, 47: 523-529.

Freeman, Gary. 2009. The rise of bilaterians. Historical Biology, 21(1-2): 99-114 doi:10.1080/08912960903295843.

Malakhov, V. V. 2004. New ideas on the origin of bilateral animals. Russian Journal of Marine Biology, 30(suppl. 1): s22-s33 doi:10.1007/s11179-005-0019-4.

Rieger, Reinhard and Peter Ladurner. 2001. Searching for the stem species of the Bilateria. Belgian Journal of Zoology, 131(suppl. 1): 27-34.

Xiao, Shuhai; Michal Kowalewski; Bing Shen; Lin Dong and Marc Laflamme. 2009. The rise of bilaterians: A reply. Historical Biology, 21(3-4): 239-246 doi:10.1080/08912960903471659.

jueves, 23 de febrero de 2012

Asintonta

Comentarios sobre la broma de la extinción del sexo masculino --en el humano, por supuesto-, por la gradual reducción del cromosoma Y a lo largo de su historia evolutiva, hasta su futura e inminente desaparición como estructura celular. [1]


7 De:
eledhwen
Fecha:
2005-03-02 21:15


Anda que...
Pues claro que disminuye.
Y seguirá haciéndolo infinitamente. Puede hacerlo sin llegar a desaparecer.
La explicación es sencillísima, se llama asíntonta.

8 De:
Maniraptora
Fecha:
2005-03-02 23:59


Vamos a moriiiiiiiir!!! no, bueno. Superado el espanto inicial, solo puedo decir q la frase de salva es sublime, y que la existencia de una asíntota es totalmente probable! solo habría q calcular el limite tendiendo a infinito, no? ah, debería haber prestado más atención a las clases de Análisis Matemático y no preguntarme en q le iba a servir calcular el limite a un estudiante de Biología Evolutiva...

9 De:
eledhwen
Fecha:
2005-03-03 01:55


Miniraptora... una asíntota no sé. Yo hablé de asintontas.
;D


Este post es retro-traido debido a que en ALT1040 [2], tocan de nuevo el tema [23 febrero 2012] y citan una conclusión experimental: Hughes et al. (2012).

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[1] El Paleofreak: La extinción del macho, o el cromosoma extrapolado [2 marzo 2005] // Link

[2] ALT1040: El hombre no desaparecerá: Una nueva teoría cuestiona la extinción del cromosoma Y [23 febrero 2012] // Link


Hughes, Jennifer F.; Helen Skaletsky; Tatyana Pyntikova; Patrick J. Minx; Tina Graves; Steve Rozen; Richard K. Wilson and David C. Page. 2005. Conservation of Y-linked genes during human evolution revealed by comparative sequencing in chimpanzee. Nature, 437: 100-103 doi:10.1038/nature04101.

Hughes, Jennifer F.; Helen Skaletsky; Tatyana Pyntikova; Patrick J. Minx; Tina Graves; Steve Rozen; Richard K. Wilson and David C. Page. 2006. Corrigendum: Conservation of Y-linked genes during human evolution revealed by comparative sequencing in chimpanzee. Nature, 441: 248 doi:10.1038/nature04776.

Hughes, Jennifer F.; Helen Skaletsky; Laura G. Brown; Tatyana Pyntikova; Tina Graves; Robert S. Fulton; Shannon Dugan; Yan Ding; Christian J. Buhay; Colin Kremitzki; Qiaoyan Wang; Hua Shen; Michael Holder; Donna Villasana; Lynne V. Nazareth; Andrew Cree; Laura Courtney; Joelle Veizer; Holland Kotkiewicz; Ting-Jan Cho; Natalia Koutseva; Steve Rozen; Donna M. Muzny; Wesley C. Warren; Richard A. Gibbs; Richard K. Wilson and David C. Page. 2012. Strict evolutionary conservation followed rapid gene loss on human and rhesus Y chromosomes. Nature advance online publication, doi:10.1038/nature10843.

Page Laboratory, Whitehead Institute, Cambridge Center // Link


[este post --Asintonta-, publicado originalmente en 2005 en MS Groups]

sábado, 28 de enero de 2012

Oportunidad ambiental

Considerando desde los fósiles más antiguos, el máximo tamaño corporal se ha incrementado en 16 órdenes de magnitud. Dentro de este incremento, se observan dos saltos discretos de similar magnitud, con innovación en la complejidad corporal y de posible relación con el incremento del oxígeno atmosférico (Payne et al. 2009: 24):

Salto Fecha Era Innovación
1 ca. 1.9 Ga Mediados del Paleoproterozoico Célula eucariota
2 0.6-0.45 Ga Final del Neoproterozoico e inicio del Paleozoico Multicelularidad


Holland (2006) describe las cinco etapas de oxigenación en la historia de La Tierra:

Etapa Fecha Característica
1 3.85-2.45 Ga El ambiente casi o totalmente anóxico.
2 2.45-1.85 Ga El nivel de oxígeno estimado en 0.02 y 0.04 atm. Océanos profundos anóxicos.
3 1.85-0.85 Ga Oxigenación leve de océanos profundos.
4 0.85-0.54 Ga El nivel de oxígeno estimado en 0.2 atm. Océanos profundos anóxicos (por lo menos en las glaciaciones).
5 0.54 Ga-presente Nivel de oxígenación actual. Oxigenación fluctuante de océanos profundos.


Torito! Se supone que en las primeras etapas de la evolución de la vida en La Tierra, el oxígeno era un subproducto biológico tóxico que empezó a acumularse en la atmósfera. Fue tan grande su efecto, que la vida tuvo que adaptarse y cambiar. Lo que inició como una tragedia mortal para la vida antigua, se convirtió en una oportunidad ambiental para la nueva. Solo se requiere de un puñado de millones de años y la evolución hace el resto. ¿Esto se aplica a nuestra contaminación? ¿Qué tan permanente es nuestra contaminación?

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Berner, Robert A. 1999. Atmospheric oxygen over Phanerozoic time. PNAS, 96: 10955-10957.

Berner, Robert A.; David J. Beerling; Robert Dudley; Jennifer M. Robinson and Richard A. Wildman. 2003. Phanerozoic atmospheric oxygen. Annual Review of Earth and Planetary Sciences, 31: 105-134 doi:10.1146/annurev.earth.31.100901.141329.

Brocks, Jochen J.; Graham A. Logan; Roger Buick and Roger E. Summons. 1999. Archean molecular fossils and the early rise of eukaryotes. Science, 285: 1033-1036.

Canfield, Don E. 2005. The early history of atmospheric oxygen: Homage to Robert M. Garrels. Annual Review of Earth and Planetary Sciences, 33: 1-36 doi:10.1146/annurev.earth.33.092203.122711.

Catling, David C. and Roger Buick. 2006. Oxygen and life in the Precambrian. Geobiology, 4: 225-226 doi:10.1111/j.1472-4669.2006.00088.x.

Cavalier-Smith, Thomas; Martin Brasier and T. Martin Embley. 2006. How and when did microbes change the world?. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 361(1470): 845-850 doi:10.1098/rstb.2006.1847.

Dismukes, G. C.; V. V. Klimov; S. V. Baranov; Yu. N. Kozlov; J. DasGupta and A. Tyryshkin. 2001. The origin of atmospheric oxygen on Earth: The innovation of oxygenic photosynthesis. PNAS, 98(5): 2170-2175 doi:10.1073/pnas.061514798.

Eigenbrode, Jennifer L. and Katherine H. Freeman. 2006. Late Archean rise of aerobic microbial ecosystems. PNAS, 103(43): 15759-15764 doi:10.1073/pnas.0607540103.

Grula, John W. 2005. Evolution of photosynthesis and biospheric oxygenation contingent upon nitrogen fixation?. International Journal of Astrobiology, 4(3-4): 251-257.

*** Holland, Heinrich D. 2006. The oxygenation of the atmosphere and oceans. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 361: 903-915 doi:10.1098/rstb.2006.1838.

Kasting, James F. 2001. The rise of atmospheric oxygen. Science, 293: 819-820.

Kasting, James F. 2006. Earth sciences: Ups and downs of ancient oxygen. Nature, 443: 643-644 doi:10.1038/443643a.

Kasting, James F. and David Catling. 2003. Evolution of a habitable planet. Annual Review of Astronomy and Astrophysics, 41: 429-463 doi:10.1146/annurev.astro.41.071601.170049.

Kasting, James F. and Janet L. Siefert. 2002. Life and the evolution of Earth's atmosphere. Science, 296: 1066-1068.

Kasting, James F. and M. Tazewell Howard. 2006. Atmospheric composition and climate on the early Earth. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 361(1474): 1733-1742 doi:10.1098/rstb.2006.1902.

Kasting, James F. and Shuhei Ono. 2006. Palaeoclimates: The first two billion years. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 361(1470): 917-929 doi:10.1098/rstb.2006.1839.

Kasting, James F.; S. C. Liu and T. M. Donahue. 1979. Oxygen levels in the prebiological atmosphere. Journal of Geophysical Research, 84(c6): 3097-3107.

Kopp, Robert E.; Joseph L. Kirschvink; Isaac A. Hilburn and Cody Z. Nash. 2005. The Paleoproterozoic snowball Earth: A climate disaster triggered by the evolution of oxygenic photosynthesis. PNAS, 102(32): 11131-11136 doi:10.1073/pnas.0504878102.

Kopp, Robert E.; Joseph L. Kirschvink; Isaac A. Hilburn and Cody Z. Nash. 2005. Was the paleoproterozoic snowball Earth a biologically-triggered climate disaster?. PNAS, 102(32): 11131-11136 doi:10.1073/pnas.0504878102.

Kump, Lee R.; James F. Kasting and Mark E. Barley. 2001. Rise of atmospheric oxygen and the 'upside-down' Archean mantle. Geochemistry Geophysics Geosystems, 2: 2000GC000114.

Lenton, Timothy M. and Andrew J. Watson. 2004. Biotic enhancement of weathering, atmospheric oxygen and carbon dioxide in the Neoproterozoic. Geophysical Research Letters, 31: L05202 doi:10.1029/2003GL018802.

Liang, Mao-Chang; Hyman Hartman; Robert E. Kopp; Joseph L. Kirschvink and Yuk L. Yung. 2006. Production of hydrogen peroxide in the atmosphere of a Snowball Earth and the origin of oxygenic photosynthesis. PNAS, 103(50): 18896-18899 doi:10.1073/pnas.0608839103.

Nunn, J. F. 1968. The evolution of atmospheric oxygen. Annals Royal College of Surgeons of England, 43(4): 200-217.

*** Payne, Jonathan L.; Alison G. Boyer; James H. Brown; Seth Finnegan; Michal Kowalewski; Richard A. Krause; S. Kathleen Lyons; Craig R. McClain; Daniel W. McShea; Philip M. Novack-Gottshall; Felisa A. Smith; Jennifer A. Stempien and Steve C. Wang. 2009. Two-phase increase in the maximum size of life over 3.5 billion years reflects biological innovation and environmental opportunity. PNAS, 106(1): 24-27 doi:10.1073/pnas.0806314106.

Sankaran, A. V. 2004. The oxygen state of the oceans of Proterozoic eon. Current Science, 87(3): 280-281.

Sleep, Norman H. 2004. Archaean palaeosols and Archaean air. Nature, 432: 1 doi:10.1038/nature03167.

Ward, Peter; Conrad C. Labandeira; Michel Laurin and Robert A. Berner. 2006. Confirmation of Romer's Gap as a low oxygen interval constraining the timing of initial arthropod and vertebrate terrestrialization. PNAS, 103(45): 16818-16822 doi:10.1073/pnas.0607824103.

domingo, 18 de diciembre de 2011

Biological Art

El estudio de los invertebrados es hoy, como los ha sido siempre, una de las mayores aventuras intelectuales. Porque es precisamente entre los invertebrados donde la vida animal se expresa sin límite de formas, colores o actividades. Puede encontrarse una profunda satisfacción en el descubrimiento de la diversidad animal, en aprender como se estudia y se admira a los animales, vivos si es posible, en la naturaleza, y en el laboratorio. Como obras de arte, los animales tienen la capacidad de deleitar nuestra vida con su particular belleza, y de desafiar la razón con facetas desconocidas para nosotros. También podemos complacernos condensando todo ello en conceptos y modelos unificadores, que nos guíen a través de la variedad de los seres vivos. [...] / Edward E. Ruppert / 7 de febrero de 1996. [1]

Torito! ¿Esto es tan fundamentalmente cierto, al punto de que el arte inicia con la representación de la forma animal? ¿La forma animal --la estructura misma- es arte aunque no tenga intencionalidad artística?

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del libro que actualmente leo:
[1] Ruppert, Edward E. y Robert D. Barnes. 1996. Zoología de los invertebrados. McGraw-Hill Interamericana. 1114 pp.

martes, 13 de diciembre de 2011

Branching Phyla

Ordenamiento de las características de diseño de plan corporal, que apoyan la hipótesis del árbol filogenético de algunos filos modernos, según el análisis molecular del rRNA 16S y 18S (Valentine 1994: 6754):
  1. colágeno, tejidos
  2. gastrulación, enterón
  3. mesodermo
  4. sistema vascular sanguíneo
  5. celoma oligomérico
  6. hemocele
  7. segmentación artrópoda
  8. segmentación anélida

012345678_Phyla
0Choanoflagellata
1Porifera
12Cnidaria
123Platyhelminthes
12345Echinodermata Chordata
12346Brachiopoda Nemertina Pogonophora Mollusca Sipunculida
123467Arthropoda
123468Annelida

Torito! ¿Celoma oligomérico versus Hemocele?

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Cartwright, Paulyn and Allen G. Collins. 2007. Fossils and phylogenies: Integrating multiple lines of evidence to investigate the origin of early major metazoan lineages. Integrative and Comparative Biology, 47(5): 744-751 doi:10.1093/icb/icm071. [a003791fx]

Chen, Jun-Yuan. 2009. The sudden appearance of diverse animal body plans during the cambrian explosion. International Journal of Developmental Biology, 53(5-6): 733-751 doi:10.1387/ijdb.072513cj. [a007131fx]

Collins, Allen G. and James W. Valentine. 2001. Defining phyla: Evolutionary pathways to metazoan body plans. Evolution and Development, 3(6): 432-442. [a004722fx]

Erwin, Douglas H.; James W. Valentine and David Jablonski. 1997. The origin of animal body plans. American Scientist, 85: 126-137. [a003781fx]

Ohno, Susumu. 1996. The notion of the cambrian pananimalia genome. PNAS, 93(16): 8475-8478. [a001842fx]

Raff, Rudolf A. 2008. Origins of the other metazoan body plans: The evolution of larval forms. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 363(1496): 1473-1479 doi:10.1098/rstb.2007.2237. [a003972fx]

Valentine, James W. 1994. Late Precambrian bilaterians: Grades and clades. PNAS, 91(15): 6751-6757. [a000914fx]

Valentine, James W.; Douglas H. Erwin and David Jablonski. 1996. Developmental evolution of metazoan bodyplans: The fossil evidence. Developmental Biology, 173: 373-381. [a007439fx]

Wray, Gregory A.; Jeffrey S. Levinton and Leo H. Shapiro. 1996. Molecular evidence for deep Precambrian divergences among metazoan phyla. Science, 274(5287): 568-573. [a001451fx]

wiki: Phylum // Link

miércoles, 19 de octubre de 2011

Turing HOX

Noordermeer et al. (2011) proponen un mecanismo de funcionamiento de los genes HOX que nos recuerda a una simple máquina de Turing. Una cinta[1] de paquetes de información concatenada (genes), que es tratada un segmento (gen) a la vez, modificándolo, para luego continuar con el adyacente. Esto explica la precisa secuencialidad en tiempo y espacio, de la activación y desactivación de los genes que dictan el patrón corporal de los organismos multicelulares. Hurtley (2011) reseña el evento.

Los genes HOX deben activarse y desactivarse en una secuencia precisa, para controlar las diferentes etapas de desarrollo embrionario, como una serie de capas, donde una es secuencia de otra.

Noordermeer et al. (2011: 225) sugieren que la activación colinear de los genes HOX, indican una separación física en sus modalidades regulatorias. La secuencia en las diferentes propiedades bioquímicas y sus resultados, asocian para cada gen, una transición por pasos de un estado negativo a otro positivo. Aunque esto requiere de ser completamente demostrado, plantea un mecanismo que soluciona los problemas cruciales durante la activación de los genes HOX:
  1. asegurar la adecuada secuencia colinear en la activación de genes;
  2. previene que los genes de activación posterior, se activen antes de tiempo;
  3. controlar y memorizar estados de transcripción asociados a los varios niveles corporales de desarrollo.


Hurtley, Hurt. 2011. A time and a place for hox genes. Science, 334(6053): 153 doi:10.1126/science.334.6053.153-h. [a007274fx]

Monteiro, Ana Sara and David E. K. Ferrier. 2006. Hox genes are not always colinear. International Journal of Biological Sciences, 2(3): 95-103. [A004840FX]

Noordermeer, Daan; Marion Leleu; Erik Splinter; Jacques Rougemont; Wouter De_Laat and Denis Duboule. 2011. The dynamic architecture of hox gene clusters. Science, 334(6053): 222-225 doi:10.1126/science.1207194. [a007273fx]

Tschopp, Patrick and Denis Duboule. 2011. A regulatory 'landscape effect' over the HoxD cluster. Developmental Biology, 351(2): 288-296 doi:10.1016/j.ydbio.2010.12.034. [a007275fx]


_____
[1] No necesariamente una fibra lineal ininterrumpida de cromatina (Noordermeer et al. 2011: 224).

wiki: Genes HOX // Link
wiki: Máquina de Turing // Link

via:
neofronteras: Descubren el primer reloj 'genético' o 'reloj Hox' // Link

domingo, 15 de mayo de 2011

Vírgenes desorejadas

Landau: El terror de los ponentes [1]

La anécdota a la que me refería sucedió en una sesión de la Academia de las Ciencias rusa. Lysenko daba una conferencia sobre esa herencia de los rasgos adquiridos. Al concluir, Landau le preguntó:

-¿Así pues, usted argumenta que si cortamos una oreja a una vaca, a su descendencia y así sucesivamente, tarde o temprano nacerán vacas desorejadas?
-Sí, es correcto.
-Entonces señor Lysenko, ¿cómo me explica que sigan naciendo vírgenes?
-Sí señor. Buena pregunta.

Torito! 200,000 años[2] de terquedad anatómica y aún no desaparece.

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via:
[1] arte y emoción: Vírgenes desorejadas // Link

[2] wiki: Evolución humana // Link

wiki: Trofim Lysenko // Link
wiki: Lev Landáu // Link

miércoles, 1 de diciembre de 2010

Mordida II

Ideas para debatir.

[Mordida I]

Paladar.

Dentro de los vertebrados, los mamíferos estamos especialmente preparados evolutivamente para tener mordida de precisión, o sea, un especializado y preciso uso de los dientes, aunado a una potente musculatura asociada.

En contra de lo que pudiera pensarse, la cadena de eventos que evolutivamente permiten esto, no está asociada al fenómeno de masticación en el adulto, siendo por lo tanto, en el adulto una consecuencia. La dinámica selectiva que dejo el camino preparado para esa funcionalidad en los mamíferos, tuvo lugar en otro proceso, la alimentación infantil a partir de la leche materna, lo que nos diferencia de los reptiles.

Nuestras crías necesitan de una adaptación muy especial para poder alimentarse de manera eficiente. Requieren, entre otras cosas, un sello, una bomba de succión y un paladar. Este fenómeno estructuralmente complejo, se explica de manera muy sencilla: la leche se succiona de la tetilla de la glándula mamaria con la boca y para facilitar la presión negativa necesaria, los labios flexibles sellan la unión. La respiración puede realizarse a la par de la alimentación, debido al la presencia del paladar, el cual separa la boca de la vía nasal. Por lo que no se requiere interrumpir la alimentación para respirar. Esto es de todos conocido.

El grupo de los reptiles no tienen ninguna de estas estructuras, excepto los más cercanos a nuestra línea evolutiva de mamífero. Los reptiles no tienen labios que pudieran funcionar como sello, ni tampoco tienen paladar, por lo que en su respiración, el aire pasa por la boca, por ser esta la única cavidad de paso para tal fin. Los reptiles de ninguna manera pueden alimentarse como las crías de los mamíferos.

Por otro lado, los reptiles -y otros vertebrados-, presentan articulación en el cráneo, lo que les permite ciertos movimientos en la cabeza (la mandíbula superior "casi" separada del cráneo, por ejemplo), imposible en los mamíferos. Esa articulación del cráneo, no les permite tener una mordida de precisión, pero si, por ejemplo tragar presas mayores.

El paladar de los mamíferos, que ayuda en la alimentación eficiente de las crías, con su presencia, fusiona la mitad derecha e izquierda del cráneo, generando un cráneo acinético (sin movimiento/articulación) y dotándolo de rigidez. Esta rigidez, es el punto importante, es útil porque prepara al cráneo para que reciba la potente musculatura para el cierre de la mandíbula y además, facilita el uso de la dentadura con precisión y eventual especialización de los dientes (los reptiles, prácticamente no tienen dientes especializados).

Torito! Esta explicación suena convincente para euterios (nosotros) pero, ¿se aplica a prototerios (nuestros más antiguos parientes mamíferos)? ¿las crías de prototerio necesitan paladar?

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Del libro que actualmente leo:
Kardong, Kenneth V. 2001. Vertebrados: Anatomía comparada, función, evolución. Mc. Graw-Hill-Interamericana. 732 pp.

sábado, 6 de noviembre de 2010

mordida

La transición de reptil a mamífero en relación con la articulación de la mandíbula con el cráneo, es un evento interesante. Es bien conocido como la posición y función de algunos huesos de la cabeza cambian a lo largo de la evolución, inclusive en la transición antes mencionada. La articulación de reptil está formada por los huesos articular-cuadrado, mientras que la de mamífero por el dentario-escamoso.

Kardong (2001: 267) plantea y responde la siguiente pregunta: ¿Cómo podrían los huesos implicados en la suspensión mandibular [de reptil] cambiar [de posición y] función sin desorganizar [la mandíbula de] las especies intermedias [hasta llegar al tipo mamífero]?

Primero, la evolución no permite esa desorganización intermedia, donde un ejemplo hipotético de interpretación sería una mandíbula inútil por falta de articulación. Segundo, al surgir la nueva funcionalidad, coexisten ambas hasta que desaparece la función antigua (o la nueva).

Hay evidencia de esto último en algunos reptiles cinodontos (en ruta intermedia hacia mamíferos). Ejemplos son Diarthrognathus y Probainognathus, con ambas articulaciones. Se desconoce la utilidad de dicha funcionalidad doble; aunque se presume que pudiera ser dar fortaleza a la mandíbula, similar a la función en un ave reciente, que se alimenta al capturar peces al volar, con el pico abierto y sumergido su parte inferior en el agua. Por supuesto, la fortaleza mandibular extra de los cinodontos mencionados, sería para lograr presas mayores a ellos.

Torito! ¿Realmente la hipótesis del aumento de la fortaleza mandibular dada por ambas articulaciones es adecuada para explicar la existencia de la nueva articulación?
  1. Es obvio pero necesario: la articulación existe si existe la articulación.
  2. ¿Cómo se genera una nueva articulación para que funcione como articulación?
  3. ¿Que función tienen tales huesos (dentario-escamoso) en la secuencia previa inmediata a la funcionalidad como articulación?
  4. La fortaleza mandibular mencionada, ¿es causa o consecuencia?

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del libro que actualmente leo:
Kardong, Kenneth V. 2001. Vertebrados: Anatomía comparada, función, evolución. Mc. Graw-Hill-Interamericana. 732 pp.

martes, 28 de septiembre de 2010

prepattern

Raíces genéticas de las mandíbulas de los vertebrados demostradas en agnados actuales por Cernya et al. (2010).

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Cernya, Robert; Maria Cattell; Tatjana Sauka-Spengler; Marianne Bronner-Fraser; Feiqiao Yuc and Daniel Meulemans Medeiros. 2010. Evidence for the prepattern/cooption model of vertebrate jaw evolution. PNAS Early Edition, September 20. doi:10.1073/pnas.1009304107. [a006648fx]

Daniel Meulemans Medeiros Lab // Link

via:
UCB Colorado News Center: Genetic clues to evolution of jaws in vertebrates unearthed by CU-Led Team // Link
NeoFronteras: Sobre el origen de la mandibula // Link

viernes, 12 de marzo de 2010

Evolution of the human dentition

teeth / evolution

Gregory, William K. 1920. The origin and evolution of the human dentition: A palaeontological review. Part I. Stages of ascent from the silurian fishes to the mammals of the age of reptiles. Journal of Dental Research, 2(1): 89-182 doi:10.1177/00220345200020011101. [A006454FX]

Gregory, William K. 1920. The origin and evolution of the human dentition: A Palaeontological review (Continued). Part II. Stages of ascent from the Paleocene placental mammals to the lower primates. Journal of Dental Research, 2(2): 215-282 doi:10.1177/00220345200020020301. [A006455FX]

Gregory, William K. 1920. The origin and evolution of the human dentition: A palaeontological review (Continued). Part III. Nature's earlier experiments in evolving large-eyed and short-jawed primates. Journal of Dental Research, 2(3): 357-426 doi:10.1177/00220345200020030201. [a006456FX]

Gregory, William K. 1920. The origin and evolution of the human dentition: A palaeontological review (Continued). Part IV. The dentition of the higher primates and their relationships with man. Journal of Dental Research, 2(4): 607-717 doi:10.1177/00220345200020041201. [A006457FX]

Gregory, William K. 1921. The origin and evolution of the human dentition: A palaeontological review (Concluded). Part V. Later stages in the evolution of the human dentition; with a final summary and a bibliography. Journal of Dental Research, 3(1): 87-228 doi:10.1177/00220345210030011101. [A006458FX]

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[entrada publicada originalmente el 12-03-2010 01:09 en Perfiles Yahoo!]

lunes, 8 de febrero de 2010

Fingers and toes

Torito! ¿Qué evolución anatómica se requiere para llegar a esto?

classic


youtube: Maksim Mrvica plays original of Flight of the bumble bee // Link


youtube: Al Hirt - Green Hornet [Flight of the bumble bee] // Link

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[entrada publicada originalmente el 08-02-2010 23:10 en Perfiles Yahoo!]

domingo, 29 de noviembre de 2009

Texas

alternative rock / 1999


youtube: Texas - In our lifetime // Link
youtube: Texas - Say what you want // Link

Me leyeron la suerte !
Con vértebras, durante el laboratorio de Morfofisiología de Cordados.
:)

-¡Maestro! le leemos su suerte.
Son una pareja de alumnos que estimo mucho y que por varios años, nos han apoyado en el trabajo de campo. Me muestran varias vértebras pequeñas de diversas especies, las que estaban algo agrupadas sobre la mesa. Terminaba la práctica de laboratorio sobre vértebras y les pareció buena idea darles un uso "más amplio".
-Si ¿por qué no?
Las toma y está a punto de dejarlas caer con mucha mística sobre la mesa, cuando atropelladamente lo detengo...
-¡Espérate venado! deja primero hacer una pregunta.
-Claro maestro.
-Esperen un poco, quiero hacer una buena pregunta.
-Se puede tardar todo lo que quiera maestro y no necesita decirnos que quiere saber.
-No, la pregunta será pública y ustedes serán cómplices.
-Bueno.
Les digo mi pregunta, la que los toma desprevenidos.
-¿Me caso este año?
Se quedan quietos y sólo se miran moviendo los ojos, hasta que uno de ellos reacciona y acepta...
-Bueno.
Le pone especial empeño para lograr sacarle la verdad a esas pequeñas estructuras y las lanza con mucho cuidado. Se vuelven a quedar quietos y de nuevo se miran sólo moviendo los ojos. El silencio se prolonga hasta que pregunto...
-¿Qué pasa?
Les cuesta decirme la respuesta y tardan en hacerlo.
-Lo sentimos mucho maestro.
-Díganme. Yo se la respuesta a mi pregunta, ¿qué dicen las vértebras?
-Maestro, dicen que no.

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Youtube: canal officialtexas // Link
Texas // Link
texasindemand.com // Link

[entrada publicada originalmente el 29-11-2009 20:13 en Perfiles Yahoo!]

sábado, 28 de marzo de 2009

Happy birth!

Torito! ¿Que vertebrados muestran la evidencia más antigua (ca. 430 a 360 ma) de fertilización interna, embriones, cordón umbilical y nacimiento vivo?

Materpiscis, Austroptyctodus and Incisoscutum.

Traduzco parte de la reseña de Ahlberg (2009: 1095):
"Trabajando en tres dimensiones con placodermos fósiles de Gogo, al oeste de Australia, Long y colaboradores descubrieron individuos de tres diferentes placodermos, Materpiscis, Austroptyctodus e Incisoscutum, los cuales contenían en su cavidad corporal, diminutas aunque perfectamente conservadas placas de la armadura de su misma especie. Cuando recién lo descubrieron, pensaron que era contenido estomacal. Pero las placas no muestran marcas de mordedura o efectos del ácido estomacal y no están mezcladas con huesos de otras especies; son los remanentes de embriones no nacidos. En Materpiscis, una estructura asociada a uno de ellos, tiene forma tubular curvada que ha sido interpretada como cordón umbilical.

Los embriones en la cavidad corporal implica fertilización interna. Se ha notado por largo tiempo que en los pictodontos, un subgrupo de placodermos a los que Materpiscis y Austroptyctodus pertenecen, poseen aletas pélvicas con dimorfismo sexual, con algo semejante a los 'claspers' usados para la fertilización interna en tiburones. Los Arthrodiros, grupo de placodermos que incluyen a Incisoscutum, no tienen los huesos externos de la diferencia sexual presente en las aletas pélvicas de ptyctodontos. Sin embargo, Long y colaboradores argumentan que la parcial preservación interna del esqueleto de la aleta de sus ejemplares, indican una estructura semejante a la de los tiburones, probablemente implicando dimorfismo sexual y fertilización interna. Ptyctodontos y arthrodiros están cercanamente relacionados y su fertilización interna y el posible nacimiento vivo de las crías, son probablemente características retenidas de su ancestro común".

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Ahlberg, Per E. 2009. Birth of the jawed vertebrates. Nature, 457: 1094-1095 doi:10.1038/4571094a. [a003650fx]

Museum Victoria: Mother fish (29 mayo 2008) // Link
Science Literature: Internal fertilization and viviparity in placoderm fish (6 marzo 2009) // Link

[entrada publicada originalmente el 28-03-2009 18:55 en Yahoo! 360]

sábado, 7 de marzo de 2009

Fishface!

Hey fishface! Don't forget who you are // Link

Torito! ¿Quien inventó la cara (o rostro)?

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AMNH American Museum of Natural History: Oldest fossil brain found in Kansas - Shark relative that lived 300 million years ago yields very rare specimen // Link

Ray Troll's: TRoLL ART.com // Link

Via:
HMNH The Hairy Museum of Natural History: Happy Darwin Day! (feb 12, 2009) // Link



Actualización el 16 de marzo de 2009:

Ya está disponible la publicación del hallazgo del cerebro fosilizado de 300 millones de años de antigüedad:

Pradel, Alan; Max Langer; John G. Maisey; Didier Geffard-Kuriyama; Peter Cloetens; Philippe Janvier and Paul Tafforeau. 2009. Skull and brain of a 300-million-year-old chimaeroid fish revealed by synchrotron holotomography. PNAS, Early Edition, online march 9, doi:10.1073/pnas.0807047106. [a003639fx]

[entrada publicada originalmente el 07-03-2009 21:06 en Yahoo! 360]