miércoles, 27 de junio de 2007

Dramatic Chipmunk

Impresionante video viral de un animalito sacado de contexto.


youtube: Dramatic chipmunk // Link



No es extraño que se logre una buena escena con estos curiosos personajes. Los perros de las pradera (prairie dogs) son muy carismáticos y se les puede observar con facilidad en su hábitat de pradera, donde son elemento muy importante. Se estima que el habitante endémico del noreste de México (Cynomys mexicanus), ha reducido su área de distribución en un 80 %. Se le considera en peligro de extinción.

  • youtube: Video Dramatic Chipmunk // Link
  • youtube: Video Original Dramatic Chipmunk // Link
  • wiki: Mexican Prairie Dog // Link
  • panoramio: Cynomys mexicanus en ANP Llano La Soledad, Galeana, Nuevo León, México // Link
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[entrada publicada originalmente el 27-06-2007 01:07 en Yahoo! 360]

    viernes, 22 de junio de 2007

    La Madre de Todos los Hamsteres

    Historia de la Ciencia.

    De cómo resolvieron la pregunta ¿será la región de control [segmento del ADN mitocondrial] lo bastante estable como para resultar útil en un estudio de evolución humana? La respuesta fue que si y fue probado con el modelo experimental hámster sirio. El resultado fue luz verde para utilizar la sección de control del ADN mitocondrial en el estudio de nuestro linaje, con cerca de 150,000 años (unas 6,000 generaciones). Aquí la historia contada por Syke (2001: 68-72):

    Aquella noche, durante el largo viaje de regreso a casa, mientras estaba pensando en otra cosa, experimenté uno de esos raros momentos en los que una idea llega de repente desde los recovecos de la mente, Dios sabe como, y sabes en un milisegundo que es la respuesta a tu problema, aunque no hayas tenido tiempo de razonar el por qué. De pronto me acordé del hámster dorado.

    Cuando yo era pequeño, leí en una enciclopedia infantil que todos los hámster domésticos del mundo eran descendientes de una misma hembra. Estoy dispuesto a jurar que no había vuelto a pensar en ello en varias décadas. Y sin embargo, la idea salía a la superficie precisamente ahora. Recuerdo que, en su momento, pensé que aquello no podía ser posible. Pero ¿y si lo fuera? Éste sería la manera ideal de comprobar la estabilidad de la región de control. Todos los hámster del mundo tendrían una línea materna que se remontará directamente a esa “Madre de Todos los Hámsteres”. Por lo tanto, habrían heredado también de ella el ADN mitocondrial, ya que en los hámsteres se transmite por línea femenina igual que en los humanos. Lo único que tenía que hacer era recolectar ADN de un conjunto de hámsteres vivos y comprobar las secuencias de sus regiones de control. No necesitaba tener linajes precisos, porque si era verdad que todo había partido de una única hembra, todos tenían que remontarse a ella. Si la región de control era lo bastante estable como para resultarnos útil, su secuencia sería la misma, o muy similar, en todos los hámsteres vivos.

    Le pedí a Chris Tomkins, un estudiante con mucha iniciativa que en el verano de 1990 acababa de empezar en mi laboratorio su proyecto de fin de carrera en genética, que viera qué podía averiguar sobre el hámster dorado. Lo primero que descubrió fue que, hablando en términos estrictos, no se llaman hámsteres dorados sino hámsteres de Siria. Chris fue a la biblioteca pública de Oxford y volvió con buenas noticias: había descubierto que existía un Consejo Nacional del Hámster Sirio en Gran Bretaña. Llamó a la secretaria y al día siguiente nos pusimos en camino hacia una dirección de Ealing, en el oeste de Londres. Allí fuimos recibidos, no sin recelos, por el secretario del Club del Hámster Sirio en Gran Bretaña, Roy Robinson (lamentablemente, ya fallecido).

    El difunto señor Robinson era un producto de una época ya pasada: un científico aficionado y autodidacta de gran distinción. Su mal iluminado despacho estaba repleto de libros sobre genética animal, muchos de ellos escritos por él mismo. Sacó su libro sobre el hámster sirio. Estaba mal de la vista, y aun con la ayuda de unas gafas muy gruesas tuvo que acercarse mucho el texto a la cara. Confirmó la historia que yo había leído de niño. Al parecer, en 1930, una expedición zoológica a los montes de la zona de Aleppo (ahora Halab), en el noroeste de Siria, había capturado cuatro curiosos roedores de color pardo-dorado, una hembra y tres machos, y los había llevado a la Universidad Hebrea de Jerusalén. Los mantuvieron juntos, y al poco tiempo la hembra quedó preñada y parió una camada. Estaba claro que no iba a haber dificultades para que se reprodujeran en cautiverio. La universidad empezó a distribuirlos en los institutos de investigación médica de todo el mundo, donde fueron bien acogidos como alternativa a las habituales ratas y ratones, aunque tenían sus inconvenientes como animales de laboratorio: sólo estaban activos por la noche, tenían mal carácter y tendían a morder a los que los manejaban (¡bien hecho!). El primer receptor fue el Consejo de Investigación Médica de Mill Hill, al norte de Londres, que cedió algunos al Zoo de Londres. En 1938 llegan a Estados Unidos los primeros hámsteres dorados.

    A veces, el personal de los laboratorios se lleva a casa animales de laboratorio que ya no son necesarios, y los mantiene como mascotas en lugar de matarlos. De ese modo, los hámsteres se fueron extendiendo de un hogar a otro y, a medida que aumentaba su popularidad, los criadores comerciales los incorporaron a sus catálogos. Empezaron a formarse grupos de entusiastas de los hámsteres.

    En 1947, en una colonia de cría apareció un hámster picazo, la primera de muchas variedades de color debidas a mutaciones espontáneas en los genes de color del pelaje, que se manifestó gracias a la endogamia de la colonia. No resultó difícil cruzar a los mutantes entre sí y producir una nueva estirpe pura. Los criadores pusieron más empeño en encontrar nuevos colores del pelaje, y en los años siguientes se descubrieron muchos mutantes de ese tipo y se establecieron estirpes puras: crema, canela, satinado, carey... Los hámsteres tenían mucha aceptación como mascotas, y la existencia de estirpes de diferentes colores hizo aumentar el interés. Así comenzó la explosión demográfica: en la actualidad hay en el mundo más de tres millones de hámsteres criados como mascotas.

    El señor Robinson vivía en un viejo vivero hortícola, que cuando nosotros lo visitamos estaba en muy malas condiciones. Un largo terreno rectangular rodeado de tapias de bonito ladrillo antiguo contenía macizos de flores excesivamente crecidos y unos cuantos invernaderos con cristales rajados y rotos. Había también dos grandes cobertizos, y el señor Robinson nos condujo al primero, situado a la izquierda, y abrió la puerta invitándonos a pasar. No dábamos crédito a nuestros ojos: en el interior había hileras y más hileras de jaulas, todas etiquetadas y numeradas, y en cada una vivía una familia de hámsteres. El señor Robinson había coleccionado una muestra de cada variedad de color producida hasta entonces, y las estaba cruzando para desentrañar la genética. Había hámsteres blanquísimos, hámsteres de color lila, hámsteres con el pelo corto y oscuro y hámsteres con el pelo largo y sedoso como una cabra de Angora. El señor Robinson tenía tanto prestigio en el mundo de los hámsteres sirios que cada vez que se descubría un nuevo mutante de pelaje se enviaba una pareja a Ealing. Estábamos contemplando la colección de referencia mundial. Como culminación, Robinson abrió una vieja lata de caramelos “Quality Street” y allí, cuidadosamente apiladas, estaban las pieles secas de los animales originales, que también se le habían enviado. Martín Richards, que había hecho el viaje con Chris y conmigo, quedó tan cautivado que se compró dos hámsteres en una tienda de Ealing antes de volver a casa. Los tuvo en su piso durante dos años, hasta que fallecieron. Lo más importante para nuestros propósitos fue que nos llevamos unos cuantos pelos de cada estirpe de la colección del Señor Robinson.

    El Señor Robinson nos facilitó también las direcciones de criadores de hámsteres y clubes de propietarios de todo el mundo, y Chris estaba a punto de escribirles para pedirles muestras de pelo cuando se nos ocurrió que aquello podría no salir bien. Ya habíamos descubierto que se necesitan muchos pelos para obtener el ADN, Los pelos de hámster son muy finos y tienden a romperse por encima de la raíz. Aunque a los animales no les importara que les arranquen unos cuantos pelos, era probable que se sintieran un poco molestos, y también sus propietarios, si pedíamos mechones grandes. Comprendimos que necesitábamos otra fuente de ADN. Entonces se nos ocurrió una idea que al principio parecía completamente disparatada. Sabíamos que la reacción de amplificación del ADN era exquisitamente sensible, y que por eso había funcionado con el ADN antiguo de los huesos arqueológicos. ¿Habría en los excrementos de los hámsteres suficiente células desprendidas de las paredes del intestino grueso? Sin duda, ni siquiera el propietario más celoso pondría inconvenientes a desprenderse de unos pocos excrementos por la causa de la ciencia. Pero ¿daría resultado? Sólo había una manera de averiguarlo. De modo que, a la mañana siguiente, Martín apareció con una cosecha fresca de los residentes de la casa. Eran bolitas secas y arrugadas, muy similares a los excrementos de ratón, y totalmente inofensivos [!!!]. Aún así, Chris utilizó pinzas para recogerlas y meterlas en un tubo de ensayo. Hirvió los excrementos durante unos minutos, centrífugo el sedimento y recogió una gota del líquido transparente para la reacción de amplificación del ADN. Funciono de maravilla.

    Durante el resto del verano estuvieron llegando pequeños paquetes de aficionados a los hámsteres de todo el mundo. En cuanto oíamos su característico sonido sonajero, sabíamos que contenían. Al fin obtuvimos ADN de 35 hámsteres, y al poco tiempo Chris había secuenciado la región de control mitocondrial de todos ellos. Todos eran absolutamente idénticas. Así pues, la historia era cierta: todos los hámsteres domésticos del mundo descienden realmente de una sola hembra. Pero lo más importante para nosotros era que la región de control se había mantenido completamente estable. Desde aquel primer hámster capturado en el desierto sirio hasta sus millones de tata-tata-tataranietos repartidos por todos los rincones del mundo, el ADN de la región de control se había copiado con absoluta fidelidad, sin un solo error.

    Era una idea asombrosa. En condiciones óptimas, los hámsteres pueden procrear cuatro o cinco camadas por año. A ese ritmo, desde 1930 había habido tiempo para engendrar por lo menos 250 generaciones de hámsteres. Aunque nuestros 35 hámsteres no hubieran tenido linajes maternos comprobados que se remontaran a 1930, el hecho de que en las secuencias de sus ADN no hubiera absolutamente ninguna diferencia quería decir necesariamente que mis preocupaciones sobre la posibilidad de mutaciones demasiado rápidas en la región de control eran infundadas. De hecho, era al contrario: resultaba que este segmento de ADN era muy fiable, nada propenso a accesos incontrolados de mutación que hicieran imposible seguir la pista de los cientos de generaciones que queríamos estudiar en nuestros antepasados humanos. Por supuesto, existía la posibilidad de que, aunque la región de control fuera estable en los hámsteres, no lo fuera en humanos. Pero esto no me pareció muy probable, dado el carácter tan fundamental de las mitocondrias, y estaba dispuesto a aceptar el riesgo.

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    PD. El sistema eliminó segmentos del texto original en la migración de Yahoo! 360 a Perfiles Yahoo.

    del libro que actualmente leo:
    Sykes, B. 2001. Las siete hijas de Eva. Editorial Debate. 302 pp.

    [entrada publicada originalmente el 23-06-2007 16:21 en Yahoo! 360]

    Ishkur's Guide to Electronic Music

    Genial catálogo gráfico de estilos de música electrónica, su evolución, relaciones y muestras! ... House, Trance, Techno, BreakBeat, Jungle, HardCore y DownTempo.

    • Ishkur's Guide to Electronic Music // Link

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    via:
    Mira y Calla // Link

    [entrada publicada originalmente el 22-06-2007 00:15 en Yahoo! 360]

    lunes, 18 de junio de 2007

    Avatar Rurouni Kenshin

    ¿Quien podría descubrir que hay bajo la tremenda coraza digital de Rurouni Kenshin? ... Jason Rowe.

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    via:
    boingboing: Avatars, and the carbon-based meatbags behind them (that's us) // Link

    NYTimes // Link

    [entrada publicada originalmente el 18-06-2007 19:51 en Yahoo! 360]

    viernes, 15 de junio de 2007

    Nessun Dorma by Paul Potts

    youtube: Paul sings Nessun Dorma high quality video/sound widescreen 16:9 // Link

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    [entrada publicada originalmente el 15-06-2007 09:28 en Yahoo! 360]

    Underground Electronic Music

    Música electrónica en dos fabulosos sitios: Electro y House by Colme y en INFAMOUS PODCAST - Underground Electronic Music. Con toneladas de MP3 de 1 hr o más de duración de Dj Sets tales como John Digweed, Out of My System, Sasha, Kazell, Ian Pooley, Fernando Riveiro, Eelke Kleijn, Nick Le Born, Kim English, Carl Cox, Nylon, Tiga, Cris Lapietra, Korruptor, Tiesto, Misstress Barbara, Paul Oakenfold, Paul van Dyk, Underworld, etc.

    • Electro y House by Colme // Música house, electro, techno, minimal, tribal... // Link
    • Infamous Podcast // Underground Electronic Music // The revolution has begun…are you ready? // Link

    PD. Y ya que andamos en esto; otros sitios ...

    • Out of Obscure // free electronic mp3 music download & community // Link
    • MixDepot.net // Spread the Sound // Link
    • Bassnectar // Link
    • InternetDJ.com // The Electronic Music Underground // Link 
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    [entrada publicada originalmente el 15-06-2007 01:15 en Yahoo! 360]

      jueves, 21 de septiembre de 2006

      Prehisteria

      "It made a generation who can code,
      a bubble before proper consoles,
      who all know
      " [1]


      Los inicios de los '80s, "it made a generation who can code", produjo una generación que debía codificar, como modo de vida. No teníamos más.

      Si necesitábamos algo --generalmente- lo teníamos que programar desde cero, todo a pie. PEEK, POKE, indirecciones (punteros), mapeo (de memoria), ensamblador, BASIC, etc ... y miles y miles de millones de páginas de manuales para tomar el control binario/hexadecimal de cada tarjeta y periférico. La interfase de abstracción HAL/HEL de DirectX --para liberar al programador de conocer cada bit de los periféricos-, ni siquiera eran un sueño descabellado.

      Una auténtica prehisteria [prehistoria]. Y ahora ... ¿que puedes hacer con 16K?

      Podemos recordar con el flash: Hey Hey 16K // Link

      ¡Alto! ... Pero si la vida existía antes de eso...

      Me toco vivir desde 1979[2] una época anterior a la de las computadoras de 8 bits (parecidas a consolas de juego), tales como la Commodore 64, la ATARI 65XE o la Sinclair ZX Spectrum, etc. Previo a esas computadoras existían unas precámbricas computadoras --llamadas "calculadoras programables"-, en las cuales la capacidad no se medía en K, sino en número de memorias. Al paso del tiempo compre o me regalaron varias y las utilice a toda profundidad, fueron la TI-55, TI-57, TI-59 (prestada), TI-66, Casio FX 702P Personal Computer y la Tandy TSR 80 PC-6 (que aún conservo y funciona).

      De entre mis triques les muestro un ejemplo sencillo de ese antiguo medrar. Es un programa que escribí para la TI-57, que calcula medias y momentos, apoyado en las rutinas estadísticas interconstruidas (x-, S+, OP 11).

      La captura del programa se inicia al oprimir la tecla LRN ("aprender") y después la secuencia de nemónicos de las columna 2 y 3 de la tabla siguiente. En la pantalla se observa la equivalencia numérica de cada instrucción (parte de la columna 4). Para correr el programa se proporcionan los datos de la columna 1 y el nemónico de la columna 2 (la etiqueta de subrutina), que lanza la secuencia de instrucciones asociadas. Las respuestas son las indicadas con flechas en la columna 4. Es una variante rudimentaria de lenguaje ensamblador junto con la sintaxis AOS. El ejemplo:

      Medias y Momentos
      OP 119.48 ST 0->115


      Lbl A' CMS 1 STO 08 STO 13 1 +/- R/S 010
      [x-] ->Lbl B' STO 00 +/- R/S 015
      [xi] ->Lbl A STO 07 Prd 08 1/x SUM 09


      RCL 07 - RCL 00 = STO 13 x RCL 13 x RCL 13


      = SUM 10 x RCL 13 = SUM 11


      RCL 07 S+ R/S 051

      Lbl B x- R/S -> [x-]


      RCL 08 INV yx RCL 03 = R/S -> [g]


      RCL 03 / RCL 09 = R/S -> [h]


      OP 11 R/S -> [m2]


      RCL 10 / RCL 03 = STO 12 R/S -> [m3]


      RCL 11 / RCL 03 = STO 13 R/S -> [m4]


      RCL 13 / OP 11 x2 = R/S -> [kurtosis]


      RCL 12 / ( OP 11 yx 1.5 ) = R/S -> [skewness]


      GTO B 115


      Donde:
      "x-" significa "x media" y también representa a su nemónico.
      "S+" representa al nemónico "sigma +"

      Programas y juegos se pueden consultar en: Old HP and TI Calculators // Link

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      [1] MJ Hibbett & The Validators: Hey Hey 16 [lyric] // Link

      [2] específicamente el 31 julio 1979, según lo estampado por mi padre en el manual de la TI-57 que me regaló. En este libro [3], está a lápiz mi primer programa escrito: OFF-ON LRN x 2 = R/S RST LRN RST

      [3] Texas Instruments. 1977. Making tracks into programming. A step-by-step learning guide to the power ease and fun of using your TI Programmable 57: A complete owner's manual for the TI Programmable 57. Texas Instruments Incorporated.


      [publicado originalmente el 21 de septiembre de 2006 en MS Groups]

      miércoles, 30 de junio de 2004

      DEM de Nuevo León

      Tabla HTML utilizada para mostrar un modelo DEM (Digital Elevation Model).

      El área considerada es de 23 00 00 a 28 00 00 N y 98 00 00 a 101 30 00 W en 42 x 60 celdas. Cada celda cubre una superficie de 5 x 5 minutos y representa un valor en msnm en el DEM mundial ETOPO5. El rango de altitud es de 5 a 3100 msnm.





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      0005 0187 0369 0551 0733 0915 1097 1279 1461 1644 1826 2008 2190 2372 2554 2736 2918 3100


      Simbología:
      o Cabecera municipal
      * Límite estatal de Nuevo León, México
      + Vértice en límite estatal
      : Pendiente decreciente hacia el E


      Actualización:

      El modelo de elevación digital mundial ETOPO5 es histórico. Su anuncio data de 1988 con solicitud de crédito a: "Data Announcement 88-MGG-02, Digital relief of the Surface of the Earth. NOAA, National Geophysical Data Center, Boulder, Colorado, 1988".

      De 1993 a 1998 lo utilizamos por su relativamente pequeño tamaño (2160x4320 datos; 18Mb), que se podía implementar con facilidad como base de datos a visualizar interpolado como grid (en pixel o ASCII y en color o monocromo), en las PC de poca memoria de la época. Se visualizaba en conjunto con información vectorial de diversas fuentes.

      Aquí se muestra un ejercicio muy posterior (2004), para expresarlo (no interpolado) como tabla HTML y ASCII, con la única finalidad de ser prueba de concepto.


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      NOAA: ETOPO5 5-minute gridded elevation data // Link
      NOAA: 5-Minute Gridded Global Relief Data Collection (ETOPO5) // Link

      [publicado originalmente el 30 de junio de 2004 en MS Groups]