martes, 25 de diciembre de 2012

speculations

-Natural sciences contain numerous laws, while in biology the laws tend to be replaced with speculations[1].

Cualquier desarrollo del conocimiento, cambia la esencia de la actividad humana, mas no disminuye su irracionalidad. Clásico que corregimos los errores --de otros- del pasado, pero somos ciegos a los propios del presente; va la biosfera de testigo (Popov 2007: 227-228).

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Popov, Igor. 2007. Man and law in evolution. Ludus vitalis, 15(27): 225-228. // Link

[1] Popov (2007: 225).

sábado, 22 de diciembre de 2012

Klerokinesis vs. Endoreduplication

torito! ¿Nuevo tipo de reproducción celular?

Choudhary et al. (2012) mencionan que esta fisión no requiere de los componentes clásicos de la citocinesis.

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Choudhary, Alka; Robert Lera; Melissa Martowicz; Jennifer Laffin; Beth Weaver and Mark E. Burkard. 2012. Interphase fission maintains genomic integrity after failure of cytokinesis in human cells. American Society for Cell Biology, annual meeting. December 15-19, The Moscone Center, San Francisco, CA.

Edgar, Bruce A. and Terry L. Orr-Weaver. 2001. Endoreplication cell cycles: More for less. Cell, 105(3): 297-306 doi:10.1016/S0092-8674(01)00334-8.

University of Wisconsin-Madison: News: New form of cell division found // Link

Nature Medicine: Spoonful of Medicine Blog: Newly discovered form of cell division may help ward off cancer // Link

wiki: Endoreduplication // Link

viernes, 14 de diciembre de 2012

Ancestral Turing-type mechanism

El desarrollo de los dedos sigue un modelo tipo Turing (Sheth et al. 2012).

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Rai, Renuka and Harjinder Singh. 1998. Experiments with a Turing gas. Journal of Biosciences, 23(1): 37-41. // Link

*** Sheth, Rushikesh; Luciano Marcon; M. Félix Bastida; Marisa Junco; Laura Quintana; Randall Dahn; Marie Kmita; James Sharpe and María Angeles Ros-Lasierra. 2012. Hox genes regulate digit patterning by controlling the wavelength of a Turing-type mechanism. Science, 338(6113): 1476-1480 doi:10.1126/science.1226804.

Zhang, Yong-Tao; Mark S. Alber and Stuart A. Newman. 2012. Mathematical modeling of vertebrate limb development. Mathematical Biosciences, in_press doi:10.1016/j.mbs.2012.11.003.

via:
El grupo de la Dra. Ros publica en Science que el patrón de formación de los dedos responde a un modelo tipo Turing // Link

viernes, 7 de diciembre de 2012

Neural crest

'The only interesting thing about vertebrates was the neural crest' Peter Thorogood comment (Donoghue et al. 2008: 530).
torito! Y no es para menos. ¿Cómo anacuas (de Ehretia anacua) evolucionó el sistema cresta neural, en el que un conjunto de células del pliegue neural --una estructura temporal en la neurulación-, viajarán y se diferenciarán en diferentes partes del cuerpo, originando hueso (osteocitos), cartílago (condrocitos), dentina (odontoblastos), neuronas, glia y células pigmentadas (iridióforos, xantóforos, eritróforos y melanocitos)?

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Abitua, Philip Barron; Eileen Wagner; Ignacio A. Navarrete and Michael Levine. 2012. Identification of a rudimentary neural crest in a non-vertebrate chordate. Nature, 492: 104-107 doi:10.1038/nature11589.

Baker, Clare V. H. 2008. The evolution and elaboration of vertebrate neural crest cells. Current Opinion in Genetics and Development, 18(6): 536-543 doi:10.1016/j.gde.2008.11.006.

Bronner, Marianne E. and Nicole M. LeDouarin. 2012. Development and evolution of the neural crest: An overview. Developmental Biology, 366(1): 2-9 doi:10.1016/j.ydbio.2011.12.042.

*** Donoghue, Philip Conrad James; Anthony Graham and Robert N. Kelsh. 2008. The origin and evolution of the neural crest. BioEssays, 30(6): 530-541 doi:10.1002/bies.20767.

Gans, Carl and R. Glenn Northcutt. 1983. Neural crest and the origin of the vertebrates: A new head. Science, 220(4594): 268-273 doi:10.1126/science.220.4594.268.

Hall, Brian K. and J. Andrew Gillis. 2012. Incremental evolution of the neural crest, neural crest cells and neural crest-derived skeletal tissues. Journal of Anatomy, 221(6): early view doi:10.1111/j.1469-7580.2012.01495.x.

Holland, Linda Z. and Nicholas D. Holland. 2001. Evolution of neural crest and placodes: Amphioxus as a model for the ancestral vertebrate?. Journal of Anatomy, 199(1-2): 85-98 doi:10.1046/j.1469-7580.199.parts1-2.8.x.

Jeffery, William R.; Takuto Chiba; Florian Razy Krajka; Carole Deyts; Nori Satoh and Jean-Stéphane Joly. 2008. Trunk lateral cells are neural crest-like cells in the ascidian Ciona intestinalis: Insights into the ancestry and evolution of the neural crest. Developmental Biology, 324: 152-160.

Sauka-Spengler, Tatjana and Marianne Bronner-Fraser. 2006. Development and evolution of the migratory neural crest: A gene regulatory perspective. Current Opinion in Genetics and Development, 16(4): 360-366 doi:10.1016/j.gde.2006.06.006.

Schlosser, Gerhard. 2008. Do vertebrate neural crest and cranial placodes have a common evolutionary origin?. BioEssays, 30(7): 659-672 doi:10.1002/bies.20775.

Trainor, Paul A.; Kristin R. Melton and Miguel Manzanares. 2003. Origins and plasticity of neural crest cells and their roles in jaw and craniofacial evolution. International Journal of Developmental Biology, 47: 541-553.

Wada, Hiroshi and Kaz Makabe. 2006. Genome duplications of early vertebrates as a possible chronicle of the evolutionary history of the neural crest. International Journal of Biological Sciences, 2(3): 133-141 doi:10.7150/ijbs.2.133.

Yu, Jr-Kai Sky. 2010. The evolutionary origin of the vertebrate neural crest and its developmental gene regulatory network: Insights from amphioxus. Zoology, 113(1): 1-9 doi:10.1016/j.zool.2009.06.001.

domingo, 2 de diciembre de 2012

El pozo

Ideas para debatir.

La diferencia entre el pobre y el rico no es la cantidad de dinero. Es un abismo llamado "la cultura de la culpa", que para el pobre se basa en el diario vivir en la conjugación de tal verbo --vivir-, de todas las maneras imaginables con la culpa; sin caer en cuenta que la conjugación --como modo de vida- es mejor con ser, ser responsable y construir. De alguna manera, la culpa, tergiversa las ansias de querer, de hacer y de tener, alejándolas de su manera correcta. Así, para los pobres, los pobres son culpables por querer, los demás por tener y la frustración procastina el hacer, hacia no hacer --ser- nada. Desde ese lado, el del pobre, no es fácil entender la utilidad de "la ética de las virtudes", el de ser el mejor --constructivamente- en sociedad. El idioma, la religión, el nivel económico y otros detalles, son accidentes geográficos "congénitos" que modelan --educan- el crecer; y requieren de esfuerzo para cambiarlos --si se quiere cambiar- si son nocivos. Y cambiar, no es parte del repertorio de las funciones con la culpa. La diferencia, entonces, es de formación: vivir sin culpa se aprende: los hijos no se cambian de bando y menos hacia ser pobres.

torito! En su medrar ¿los ricos sienten culpa? ¿alguien ha visto a algún rico sentir culpa, al moverse con soltura al filo de las normas? ¿Cuál es la --supuesta- utilidad de la culpa?

La moral surge de las virtudes, no de las reglas, ni de los resultados[1].

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[1] wiki: Ética de las virtudes // Link

via:
eliax: 21 formas en que los ricos piensan diferente a la persona promedio // Link

viernes, 17 de agosto de 2012

tic tal' ik

Plantearon que tal organismo debía existir. Determinaron donde buscar su fósil, lo buscaron y lo encontraron.

La descripción de Tiktaalik roseae (gen. et sp. nov.) por Daeschler, Shubin and Jenkins (2006).

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Conway-Morris, Simon. 2010. Evolution: Like any other science it is predictable. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 365(1537): 133-145 doi:10.1098/rstb.2009.0154.

Daeschler, Edward B.; Neil H. Shubin and Farish A. Jenkins. 2006. A Devonian tetrapod-like fish and the evolution of the tetrapod body plan. Nature, 440: 757-763 doi:10.1038/nature04639.

wiki: Tiktaalik // Link

jueves, 16 de agosto de 2012

First terrestrialization

El primer avance terrestre de los vertebrados acuáticos en el Paleozoico, fue interrumpido en un intervalo de tiempo de 15 millones de años, denominado Romer's Gap (Brecha de Romer), en el cual pocos fósiles son conocidos. Demostramos que ocurre el mismo patrón para los artrópodos terrestres, por lo que concluimos que el Romer's Gap es real (Ward et al. 2006: 16818).

Smithson et al. (2012: 4532) concluyen que el gap es un artefacto de colección.

Retallack (2011: 235), como un artefacto de preservación.

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Retallack, Gregory J. 2011. Woodland hypothesis for Devonian tetrapod evolution. Journal of Geology, 119(3): 235-258 doi:10.1086/659144.

Smithson, Timothy R.; Stanley P. Wood; John E. A. Marshall and Jennifer A. Clack. 2012. Earliest Carboniferous tetrapod and arthropod faunas from Scotland populate Romer's Gap. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(12): 4532-4537 doi:10.1073/pnas.1117332109.

Ward, Peter D.; Conrad C. Labandeira; Michel Laurin and Robert A. Berner. 2006. Confirmation of Romer's Gap as a low oxygen interval constraining the timing of initial arthropod and vertebrate terrestrialization. Proceedings of the National Academy of Sciences, 103(45): 16818-16822 doi:10.1073/pnas.0607824103.

wiki: Romer's gap // Link 
wiki: Artifact (error) // Link

domingo, 12 de agosto de 2012

biological oddity

Se puede concluir que los kiwis (Apteryx, Struthioniformes : Apterygidae) son una rareza biológica, con varias características más propias de los pequeños mamíferos que de las aves (Sales 2005: 1, 16).

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Baker, Allan J.; Charles H. Daugherty; Rogan Colbourne and John L. McLennan. 1995. Flightless brown kiwi of New Zealand possess extremely subdivided population structure and cryptic species like small mammals. Proceedings of the National Academy of Sciences, 92(18): 8254-8258.

Sales, James. 2005. The endangered kiwi: A review. Folia Zoologica, 54(1-2): 1-20. // Link

wiki: Apteryx // Link

lunes, 6 de agosto de 2012

Feeling wild places

Hafner (2007: 1119) menciona el lugar donde los biólogos deberíamos completar el círculo de aprender:

En su memorable "Joseph Grinnell Award lecture", que David J. Schmidly presentó ante los miembros reunidos de la Sociedad Americana de Mastozoología en junio de 2004, expresó de manera elocuente, su preocupación por la pérdida continua de los programas de historia natural en las instituciones académicas de todo el país. Comentó que "gran parte de la historia natural se realiza fuera-de-aula, en lugares medianamente salvajes" y lamentó el hecho de que "la historia natural en el campo, es desalentada en muchos programas académicos biológicos en los Estados Unidos de hoy" (Schmidly 2005: 452, 454).

Pocos de nosotros podríamos olvidar, la emoción y maravillas de nuestras primeras experiencias en esos "lugares silvestres".

Es cierto. Cuando empezamos la educación formal en biología, a la naturaleza la vemos con otros ojos, desde otra perspectiva. Al regresar al campo, es increíble notar que las cosas aprendidas en clase son ciertas, y me refiero por supuesto, a los fenómenos que podemos notar por estar cerca de nuestra experiencia. Así, la anterior vivencia común y sencilla, se convierte en un orden que permite la capacidad predictiva. De entre las cosas que llaman nuestra atención inicial, resalta la vegetación, donde cada especie vegetal --o animal- tiene su lugar. Con la novata visión del alumno que empieza, una secuencia de mi experiencia: primero, reconociendo a las especies ya antes observadas; luego, descubrir las para uno no conocidas; para llegar por fin a la magia de la ciencia: que respecto a nuestra particular zona y vegetación, deberíamos poder encontrar... y caer rendido ante la predicción con resultado cierto. Es imposible esta secuencia en el aula de clase. No se requieren grandes cosas, lo que se requiere es vivirlas.

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Grinnell, Joseph. 1917. Field tests of theories concerning distributional control. American Naturalist, 51(602): 115-128.

Hafner, Mark S. 2007. Field research in Mammalogy: An enterprise in peril. Journal of Mammalogy, 88(5): 1119-1128 doi:10.1644/07-MAMM-S-139.1. // Link

Schmidly, David James. 2005. What it means to be a naturalist and the future of natural history at American universities. Journal of Mammalogy, 86(3): 449–456 doi:10.1644/1545-1542(2005)86[449:WIMTBA]2.0.CO;2. // Link

sábado, 21 de julio de 2012

You touch my inner smile

"Esta cantante me recuerda como algunas mujeres pasan tan fugaces, que el corazón queda en desarreglo, con ansias de consuelo eterno... yeah, yeah, yeah.


youtube: Texas - Inner smile // Link